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5'UTR
:
region at the
5' end of a mature transcript (preceding the
initiation
codon) that is not
translated into a protein
3'UTR: 3‘
端非翻译区,也就是
mRNA
两端的非编码片段
顺便介绍一下
“
转录本
”
(转载解螺旋公共号)
我们平常通过数据库查找某个基因的相关信息时,会发现该基因有多个转录本。
为什么一个基因可以有多个转录本呢?转录本能干什么?
转录本其实就是基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白
质的成熟的
mRNA
。
一个基因有可能有多个转录本,
原因是由于不同的剪接方式造成的。
我们都知道,
基因转录之后,首先是形成前体
m
RNA
,通过剪切内含子连接外显子,
5’
端加帽
及
3’
端加尾之后形成成熟
的
mRNA
。
但是在剪切的过程中可能会剪切掉外显子,
也有可能保留部分内含子,
这样就形
成了多种
mRNA
即
多个转录本。
举个栗子:这是一个
三个外显子两个内含子的基因结构图
该图通过不同的剪接方式得到了四
种
mRNA
即四种转录本(我只是列出了部分
< br>可能性)
,
实际中可能该基因只具有其中的一种或两种转
录本,
也有可能都具有。
我们需要特
别注意的是大多数基因有多个转录本,
而且有可能每个转录本都会编
码产生相应的蛋白,这样就有可能造成一个基因有多种功能。
我们平常研究某个基因时
(该基因有多个转录本)
,
其实我们研究的是它的其中
一个转录本所编码的蛋白的功能。
虽然该基因有多个转录本,
而且每个转录本都
编
码蛋白,
但是一般情况下它的不同的转录本分布在不同类型的细胞中,
< br>当然也
有可能多种转录本同时存在于某一细胞中。
那我们研究该基因时应该怎么做呢?
首先,我们需要确定我们应该研究该基因的哪个转录本。
p>
因为我们平常研究某个基因的功能的时候,
是因为该基因在某一特定
的组织和细
胞中表达,
它在这些组织和细胞中具有特定的功能,
所以我们只需要确定该基因
的哪个转录本在这些组织和细胞中表
达即可。
确定的方法当然就是设计每种转录本特异性引物,<
/p>
然后通过
RT-PCR
就可知道哪
种转录本在组织和细胞中特异性表达。那这个转录本就是我们接下来要研究的。
之所以要确定我们应该研究哪个转录本,
那是因为它
关系到引物的设计以及蛋白
分子量的计算。
< br>当我们研究某个基因的功能时,通常会抽提总的
RNA
,
然后反转录得到
cDNA
,
然后将
p>
cDNA
连接到表达载体中转化到原核或真核细胞中进行表达,
p>
然后进行接
下来的研究。
通过反转录获得
cDNA
时,
引物的设计就是根据转录本设计的。
而且之后我们会
将表达的蛋
白跑电泳后进行分析,
那蛋白的大小是如何计算的呢,
当然也是
通过
该转录本编码的蛋白的氨基酸序列计算的啊。
至于转录本的查询,也非常简单。在
pubmed gene<
/p>
一栏输入目的基因,出现的
页面下拉,发现如下
< br>
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