-
碱基符号
生物信息
学中常用的
18
个碱基字母
字母
碱基
单碱基
A
A
C
C
G
G
I
I
T
T
U
U
二碱基
K
G/T
M
A/C
R
A/G
S
G/C
W
A/T
Y
C/T
三碱基
B
C/G/T
D
A/G/T
H
A/C/T
V
A/C/G
四碱基
N
A/C/G/T
X
A/C/G/T
全称
Adenine
Cytosine
Guanine
Isosine
Thymine
Uracil
Keto
aMino
puRine
Strong
pair
Weak pair
pYrimidine
Not
A
Not C
Not G
Not U (or
T)
Any
Unknown
说明
腺嘌呤
胞嘧啶
鸟嘌呤
次黄嘌呤
胸腺嘧啶
尿嘧啶
含酮基
含氨基
嘌呤
强配对
弱配对
嘧啶
非
A
非
C
非
G
非
U(T)
任一碱基
未知碱基
氨基酸
A
C
D
E
F
H
名称
丙氨酸
Name
'alanine
简写
Ala
Cys
Asp
Glu
Gly
His
密码子
GCX
TGM
AAM
GAP
TTM
GGX
CAM
分子量
121.15
132.12
147.13
165.19
155.16
残基
103.14
114.11
129.12
147.18
137.15
A
108.5
117.7
138.4
189.9
153.2
3
A
135
160
190
210
195
2
ml/g
丰度
748
631
619
643
774
670
pI
pKa
亲水
疏水
侧链
-CH
2
SH
-CH
2
CONH
2
-CH
2
CH
2
COO
CH
2
(C
6
H
5
)
-H
+
-
89.09
71.08
88.6
115
7.55
6.0
1.69
5.0
9.3
4.52
5.4
6.32
4.07
5.5
6.84
6.0
2.24
0.45
0.5
-CH
3
3.63
-2.8
13.31
12.58
0
12.62
-7.4
-9.9
0
半胱氨酸
cy'stine
天冬氨酸
'asparic
acid
谷氨酸
glu'tamic acid
'glycine
'histidine
苯丙氨酸
pheny'lalanine
Phe
组氨酸
3.15
2.5
G
甘氨酸
75.07
57.06
60.1
75
632
0.5
-CH
2
(C
3
N
2
H
4
)
I
K
L
N
P
R
S
T
V
Y
异亮氨酸
iso'luecine
赖氨酸
亮氨酸
'lysine
'luecine
me'thionine
'proline
'arginine
'serine
'threonine
'valine
'tryptophan
'tyrosine
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln
Arg
Ser
Thr
Val
Trp
Tyr
ATM,ATA
AAP
CTX,TTP
ATG
GAM
CCX
CAP
131.17
146.19
131.17
149.21
133.10
115.13
146.15
113.17
128.18
113.17
131.21
115.09
128.14
156.20
101.11
186.21
163.18
166.7
168.6
166.7
162.9
111.1
143.9
173.4
116.1
227.8
193.6
175
200
170
185
150
145
180
225
140
155
255
230
884
789
885
745
579
758
674
666
613
689
847
734
712
5.72
5.93
6.2
0.24
2.5
-CH(CH
3
)CH
2
CH
3
11.91
-4.2
-(CH
2
)
4
NH
3
< br>
-CH
2
CH(CH
3
)
2
-(CH
2
)
2
SCH
3
-CH
2
COO
-(CH
2
)
3
- <
/p>
-CH
2
CH
2
CONH
2
+
-
+
9.33
6.0
5.30
4.5
0.11
1.8
12.07
11.77
22.31
-0.2
-3.3
-0.3
M
蛋氨酸
脯氨酸
精氨酸
丝氨酸
苏氨酸
缬氨酸
酪氨酸
2.35
5.8
10.4
3.87
1.3
4.92
6.3
4.02
5.7
4.6
5.15
~12
7.22
5.7
5.74
6.5
6.52
6.0
1.25
3.19
9.7
天冬酰胺
a'sparagine
97.12
122.7
Q
谷氨酰胺
'glutamine
CGX,AGP
174.20
TCX,AGM
105.09
ACX
GTX
TGG
TAM
119.12
117.15
204.23
181.19
-11.2
-(CH
2
)
3
CH(
NH
2
)
NH
2
-CH
2
OH
-CH(OH)CH
3
CH(CH
3
)
2
-CH
2
(C
8
N
1
H
6
)
CH
2
(C
6
H
4
)OH
87.08
89.0
115
99.14
140.0
7.45
-0.3
7.27
0.4
0.40
1.5
8.28
3.4
8.50
2.3
W
色氨酸
注：密码子说明见碱基符号；
A
3
和
A
2
分别是埃为单位的体积和面积；
ml/g
为溶解
1g
所需水量；丰度为
SwissProt
蛋白质数据库中的氨基酸丰度。张闻制作
2009.6
希腊字母
24
个希腊字母的拼写、读音和含义
Greek
Α
α
Β
β
Γ
γ
Δ
δ
English
Spell
A
B
G
D
alpha
beta
gamma
delta
Read
alfa
bet'a
gamma
delt'a
Chinese
阿耳法
贝塔
伽马
德耳塔
Usage
1st,
closest
, best, letter, α
-ray
2nd, β
-ray
3rd,
γ
-ray
4th,
Δ
-shape, variable increment
Ε
ε
Ζ
ζ
Η
η
Θ
θ
Ι
ι
Κ
κ
Λ
λ
Μ
μ
Ν
ν
Ξ
ξ
Ο
ο
Π
π
Ρ
ρ
Σ
Τ
σ (?)
τ
E
Z
H
Q
I
K
L
M
N
X
O
P
R
S
T
U
C
Y
W
epsilon
zeta
eta
theta
iota
kappa
lambda
mu
nu
xi
pi
rho
sigma
tau
upsilon
phi
chi
psi
omega
ep'silon
zet'a
et'a
θit'a
iot'a
k'app'a
lambda
miu
niu
ksi
p'ai
rou
sigma
t'au
fai
khai
p'sai
omiga
艾普西隆
5th, math
small residue
截塔
艾塔
西塔
约塔
卡帕
兰姆达
缪
纽
克赛
派
柔
西格马
套
弗艾
忾
普西
欧米伽
6th
7th, math
y
substitutive
8th, math target
9th, few
10th, often replaced by c in English
11th, λ
-
particle,
λ
-phage
12th, 10
,
average
13th, name unknown, error,
speed
14th, math
x
substitutive
16th, 3.1415926, chaos
17th
18th, standard deviation
19th, T-shape, 300, time
21th
22th
23th,
pseudo
24th, end, all
-6
omicron
omik'ron
奥密克戎
15th
Υ
υ
Χ
χ
Ψ
ψ
Ω
ω
jup'silon
衣普西隆
20th
Φ
Φ
(φ)
F
张闻制作
2009.6
生物分子的功能基团
中文
烃基
甲基
乙基
苯基
含氧基
羟基
(
醇
)
英文
methyl
ethyl
phenyl
hydroxyl
(alcohol)
基团
-CH3
-C2H5
-C6H5
-OH
举例
丙氨酸
亮氨酸
苯丙氨酸
糖
丝氨酸
甘油
备注
酰基
(
酯
)
羧基
(
酸
)
羰基
(
酮
)
醛
醚
酐
含氮基
氨基
酰胺
胍
咪唑
含硫基
巯基
二硫键
硫酯
含磷基
磷酸根
磷酸酐
酰基磷酸
actyl
(ester)
carboxyl
carboxyl (ketone)
aldehyde
ether
anhydride
amino
amido
guanidine
imidazole
sulfhydryl
disulfide
thioester
phosphoryl
phosphoanhydride
acyl phosphate
-COO-
-COO
-CO-
-CHO
-O-
-COOCO-
-NH2
-CONH2
-CN3H4
-C3N2H3
-SH
-SS-
-COS-
-PO4H
-PO4PO3-
-COPO4H
脂类，乙酰胆碱
氨基酸
脂肪酸
柠檬酸
丙酮酸
葡萄糖
乙醚
碳酸酐
氨基酸
谷氨酰胺
精氨酸
色氨酸
嘌呤
半胱氨酸
胱氨酸
乙酰辅酶
A
核苷酸
ATP
磷酸化蛋白
碱性
碱性
还原性
激活作用
能量利用
化学元素周期表
化学元素周期表的原子序号、符号、原子量和生物含量
1
H
氢
1.008
2
He
氦
4.003
3
Li
锂
6.941
4
Be
铍
9.012
5
B
硼
10.81
6
C
碳
12.011
7
N
氮
14.007
8
O
氧
15.999
9
F
氟
18.998
10
Ne
氖
20.180
11
Na
钠
22.990
12
Mg
镁
24.305
13
Al
铝
26.982
14
Si
硅
28.086
15
P
磷
30.974
16
S
硫
32.065
17
Cl
氯
35.453
18
Ar
氩
39.948
-
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