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转录组测序

作者:高考题库网
来源:https://www.bjmy2z.cn/gaokao
2021-02-27 21:22
tags:

-

2021年2月27日发(作者:bored的用法)


转录组分析



研究背景:



RNA-Seq


是通过结合实验和计算方法来鉴定生物样品中


RNA

序列的种类和丰度的一种技术。


通过


RNA-seq


,我们就能够确定单链


RNA


分子中


ATCG


的顺序。整个过程主要包括:从细胞


或 组织中提取


RNA


分子、文库的构建以及后继的生物信息学数据 分析。


RNA-Seq


技术具有


许多早 期研究方法(如:微阵列)所不具备的优点,如:


RNA-Seq


平台的高通量、新技术所


带来的高灵敏度、发现新转录本、新基因模型以及非编码


RNA


的能力等。




RNA-Seq


技术的到来,使人们 认识到,无论是单细胞模式生物还是人类,我们对其转录组的


认知异常匮乏。

< p>


RNA-Seq


产生的新的数据,


则可以帮助我们发现基因结构上的巨大差异、


鉴定出新的转录本以及能够对< /p>


small


non-coding


R NA



lncRNAs


有着更好的了解 。而且随着


测序花费的降低,


RNA- Seq


的优势体现的更加明显。






服务流程:













样品选取



利用


Oligo- dT


富集


mRNA
























mRNA


片段化



cDNA


合成



末端修复、加


polyA


、加接头,


PCR


扩增




数据分析






















测序方案:



内容:


TotalRNA


检测,普通转录组文库构建及测序及 信息分析。



测序方式:


HiseqP E125




项目周期:有参


45


天,无参


50


天。




分析内容:



无参考基因组:



1.1


质量控制





1.11


评估碱基质量





1.12


过滤低质量


reads




1.13


去掉低质量碱基和接头序列





1.14


统计

N


比例和


reads


长度





1.15


统计


GC


含量和


r eads


重复度



1.2


Reads


的从头比对组装


-


-


-


-


-


-


-


-



本文更新与2021-02-27 21:22,由作者提供,不代表本网站立场,转载请注明出处:https://www.bjmy2z.cn/gaokao/676068.html

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