转录组

，而

Illumina Solexa GA IIx

和

AB SOLID 4

数据读 取量大，能够得到较高

的覆盖率，

可以较好的降低成本。

若是位置基因组序列的物种，

则

Roche GS FLX

Titanium

测序更有优势，其较长的读长 便于拼接，获得更好的转录本数据。

转录组测序可以供研究者 在转录本结构研究

（基因边界鉴定、

可变剪切研究等）

，

转录本变异研究（如基因融合、编码区

SNP

研究），非编码区域功能研究

（

Non-coding RNA

研究、

mi RNA

前体研究等），基因表达水平研究以及全新转

录本发现等 方面进行深入研究。

研究转录组的方法有哪些？

答：

目前研究转录组的方法主要三种，

基于杂交技术的

< br>cDNA

芯片和寡聚核苷酸

芯片，

基于

sanger

测序法的

SAGE (serial analysis of gene expression)

、

LongSAGE

和

MPSS(massi vely parallel signature sequencing)

，基于第 二代测序技术的转录

组测序，又称为

RNA- Seq

。

转录组测序比其他研究方法有哪些优势

?

答：转录组测序具有以下优势：（

1

）可以直接测定每个转 录本片段序列、单核

苷酸分辨率的准确度，

同时不存在传统微阵 列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反

应和背景噪音问题；（

2< /p>

）灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录

本；（

3

）可以对任意物种进行全基因组分析，无需预先设计特异性探针， 因此

无需了解物种基因信息，

能够直接对任何物种进行转录组分 析，

同时能够检测未

知基因，

发现新的 转录本，

并准确地识别可变剪切位点及

cSNP

，

UTR

区域。

（