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酶
切
位
点
识
别
序
列
Document serial number
【
KKGB-
LBS98YT-BS8CB-BSUT-BST108
】
酶切位点（
Restriction Enzyme
cutting site
）：
DNA
上一段碱基的特定序
列，能够识别出这个序列并在此将序列切成两段。
< br>
可能存在同尾酶，不同酶的识别序列不同，
有的可
能能识别多个酶切位点比如
STY1
识别序列有
WW
PCR
引物设计时酶切
位点的保护碱基表
不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数
目的要求（在本表中没有列出的
酶，则通常需在识别位点两端至少加上
< br>6
个保护碱基，以确保酶切反应的进行。）
保护碱基：
当酶切位点在双链
DNA
的尾端时，限制性内切酶经常不能成功切断
(
简单的
想象为酶遇到识别位点之后从旁边掉下去了…… =_=|||)所以经常在引物设计时
，在末
端的限制性内切酶识别位点之后再加上
2
、
3
个碱基以确保成功酶切。比如你的引物是
5‘ GCTAGCNNNNN……
3’ 可以改成
5‘
CAGGCTAGCNNNNN……
3’ 呃……CAG
是我随
便加的，你可以考虑一下
CG/AT
含量
酶
寡核苷酸序列
G
GTCGAC
C
Acc I
CG
GTCGAC
CG
CCG
GTCGAC
CGG
C
ACATGT
G
Afl III
CC
ACATGT
GG
CCC
ACATGT
GGG
GGCGCGCC
Asc
I
A
GGCGCGCC
T
TT
GGCGCGCC
AA
C
CCCGGG
G
Ava I
CC
CCCGGG
GG
TCC
CCCGGG
GGA
C
GGATCC
G
BamH I
CG
GGATCC
CG
CGC
GGATCC
GCG
C
AGATCT
G
Bgl II
GA
AGATCT
TC
GGA
AGATCT
TCC
链
长
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
12
切割率
%
2
hr
0
0
0
0
>90
>90
>90
>90
>90
50
>90
>90
10
>90
>90
0
75
25
20 hr
0
0
0
0
>90
>90
>90
>90
>90
>90
>90
>90
25
>90
>90
0
>90
>90
G
GCGCGC
C
BssH II
AG
GCGCGC
CT
TTG
GCGCGC
CAA
BstE II
G
GGT(A/T)ACC
C
AACTGCAGAA
CCAATGCATTGG
BstX I
AAAACTGCAG
CCAATGCATTGG
AA
C
TGCAGAA
CCAATGCATTGG
ATGCAT
C
ATCGAT
G
Cla I
G
ATCGAT
C
CC
ATCGAT
GG
CCC
ATCGAT
GGG
G
G
^
A
ATTC
C
EcoR I
CG
G
^
AATTC
CG
CCG
G
^
AATTC
CGG
GG
GGCC
CC
Hae III
AGC
GGCC
GCT
TTGC
GGCC
GCAA
Hind II
I
C
A
^
AGCTT
G
CC
A
^
AGCTT
GG
CCC
< br>A
^
AGCTT
GGG
G
GGTACC
C
Kpn I
GG
GGTACC
CC
CGG
GGTACC
CCG
Mlu I
G
ACGCGT
C
CG
ACGCGT
CG
C
CCATGG
G
CATG
CCATGG
CATG
C
CATATG
G
Nde I
CC
CATATG
GG
CGC
CATATG
GCG
GGGTTT
CATATG
AAACCC
8
10
12
9
22
24
27
8
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
12
8
10
8
14
8
10
12
18
0
0
50
0
0
25
25
0
0
>90
50
>90
>90
>90
>90
>90
>90
0
0
10
0
>90
>90
0
25
0
50
0
0
0
0
0
0
>90
10
0
50
>90
0
0
>90
50
>90
>90
>90
>90
>90
>90
0
0
75
0
>90
>90
0
50
0
75
0
0
0
0
Nco I
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