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Prescission
蛋白酶制作及使用方法
柱下酶切用酶的制作方法
1L TB
菌体用
PBS
重悬至
< br>35ml
做高压裂解,最终
40ml
总量。上清用
0.5ml
流速,挂
3-4ml
柱子,
PBS
漂洗
30ml
。用含有
10%
甘油的洗脱液洗脱,每管收集体积为
2ml
,只取主峰,可以
粗略定量,也可以
取百分之一的量在
Akta
< br>上用上样泵来做积分定量
(参考下面的积分定量方法举例)
。
也可以用分光光度
计定量,一般可用稀释
< br>20
倍定量。马上分装成
0.25mg
< br>每管,可切
5ml
介质。
柱上酶切用酶的制作方法
亲和纯化方
法同柱下酶切,洗脱液不含甘油,得到
10ml
左右洗脱液,浓
缩
10
倍,再加入
10ml
含有
10%
甘油和
2m
M
DTT
的
PBS
< br>稀释,一共浓缩三次换
buffer
,每次浓缩时间一般
在
30
分钟以内。最终
浓缩至
10mg/ml
,浓缩
10
分钟混匀一次。尽快分装成
0.25mg
每管,可切
5ml
介质。
柱上
酶切用酶的
Q
纯化制作方法
亲和纯化方法同柱下酶切,洗脱液不含甘油,收集后加水大于三分之一。过
Q
柱,
AB
液配方中含有
10%
甘油,
8%B
洗脱
,
50%B
?直接洗下后积分定量,分装。
粗略定量参考
2000
峰宽为
10.5ml
,蛋白质总量为
24mg
,取了
12ml
,浓度为
2mg/ml
,直接分装的话,可以用
125ul
和
250ul
每
份。
积分定量方法举例
取
10ul ppase
浓缩液,
p>
用本底缓冲液
(
PBS
)
稀释到
500ul
,
用上样泵做积分定量,
积分体积为
325mAu*
ml
,
可知浓缩好的蛋白质光吸收为每毫升为
< br>32.5Au
,光吸收为
1
,浓
缩好的蛋白质浓度为
32.5mg/ml
,一共
24mg
蛋白。
表达
1.
取
-80
度保存的质粒
pGEX-PPase
转化
BL21
< br>(
DE3
)感受态,涂布,
37
度孵箱培养
12~16
h
。
2.
挑取单克隆到
50ml LBA
培养基
37
度培养
12-15
小时。
3.
1%
接种到
1L TBA
中,培养
3
小时,
4
度水浴降温,加终浓度为
0.2mM
的
IPTG
,
15.3
度诱导培养
18
小时。
4.
4000rpm
离心
20
分钟收菌。加入
PB
SE
(
1mM EDTA
)至终体积<
/p>
30-40ml
重悬。
纯化
1
.
高压裂
解
2-3
次。
2
.
1.5
万转离心
30
分钟,留上清。
3
.
PBSS
平衡
5ml
的
p>
GST
柱,上样,
PBSS
漂洗,
4
℃放置过夜,等
RN
A
降解,再用含有
10%
甘油和
0.1% Tween20
的酶切
buffe
r
漂洗干净。洗脱用含
10%
甘油的还
原性谷胱甘肽溶液,
2ml
每管收集,
取峰尖
3*1.5ml
。
4
.
上样泵
灌盐酸胍再生柱子,重力流灌水,灌
20%
乙醇,
4
℃保存柱子。
酶切效率确定
5ul
,
10ul
,
20ul
酶切
PH35C
蛋白
3-4
天,电泳检测酶切产物,全部切开了。估计
10ul
p>
过夜酶切
1L
的
培
养产物足够,下次实验再做验证。
保存
用
PC
R
管,分装
50ul
每管,冻存于
p>
-80
度。
使用
谷胱甘肽洗脱的融合蛋白,加入
1
份
PPase
,混匀后
4
度过夜酶切。
缓冲液
1
.
10*PBSS
(欧蒙基础)
配方:
5
包
PBS<
/p>
粉剂(欧蒙)
,加入
360ml 5M
NaCl
,定容到
500ml
,
4
℃保存。
2
.
500ml 2M Tris
(
pH8
.0
)
,
500ml 2M Tris
(
pH7.4
)
350ml
水溶解
121.1g
Tris
碱,加转子搅拌或振荡下溶解(需要
< br>10
分钟左右)
,加浓盐酸调
p
H
至所
需值,抽滤后
4
℃保存。
如温度升高,可加入预冷的水降温,温度下
降
1
度
pH
升
高
0.03
。
pH6.8
约需盐酸
160 ml
,
p
H7.4
约
需盐酸
70 ml
,
7.6
约需
60ml
,
8.0
约需
42ml
,
8.0
约需
40ml
。
Tris
缓冲液稀释
10
倍
p
H
下降
0.1
,故如稀释为
20mM
使用,则
pH
下
降
0.2
。
3
.
1L
2M Tris
不调
pH
800ml
水溶解
242.2g Tr
is
碱,加转子搅拌,定容至
1L
,抽
滤后
4
℃保存。
4
.
500ml 0.5 mM EDTA
将
93.05g
二水乙二胺四乙酸二钠加入
400ml
水中,加入氢氧化钠颗粒调节
pH
(约需
p>
10g
氢氧化钠
颗粒)
,先加入
7g
左右,用搅拌棒彻底搅匀,在转子搅拌下,使
其大部分溶解,静置一会儿,使气
泡排出,并观察沉淀量。再继续搅拌,少量加入氢氧化
钠颗粒,观察
pH
变化,勿使其变化过快,
完全溶解后,加入
4
℃预冷的水(此时
pH
升高)
,继续调节
pH
为
8.0
,最终定容至
1L
,抽滤除去
杂质,避光保存于
4
℃。
5
.
10%
Tween 20
2ml Tween 20
,溶于
20ml
水,避光保存,千分之一稀释使用(根据
GE
资料)
。
6
.
250ml 20*
酶切
buffer
储存液
400mM Tris-
HCl (pH 7.0-pH 8.5), 3 M NaCl, 20 mM EDTA
配方:
2M Tris-HCL
50
ml
5M NaCL
150
ml
0.5M EDTA
10 ml
工作液成分(
2M Tris
稀释
p>
100
倍使用,
pH
值会下降
0.2
)
:
20mM Tris-
HCl
,
150mM NaCl, 1 mM EDTA
作为漂洗液,使用前添加
0.1%
Triton
X100
(或者
Tween20
)
,做为酶切液使用前添加<
/p>
0.01%
Triton
(或者
Tween20
)和
1mM
DTT
。
7
.
100ml
20
×还原性谷胱甘肽储液
成分:<
/p>
200mM
还原型谷胱甘肽,
50mM
NaCl
,
1mM
EDTA
,
0.01% Triton X-100
(用欧蒙
Tween20
替代)
< br>,
100mM Tris
(
pH
8.0
)
50ml
< br>离心管
1
支,
称取
6.14g
还原型谷胱甘肽,
加
20ml 5M NaCl
,
4ml 0.5M
EDTA
,
0.2ml 10% Tween20
再加水溶解至
50ml
,
倒
入
100ml
烧杯,
再量取
50ml 2M Tris
(
pH8.0
)
,
倒入
100ml<
/p>
烧杯,
搅拌溶解,
滤器过滤至
50ml
离心管,
1ml
分装冻存于
-20
度。
8
.
500ml 7M
盐酸胍
称取
334.4g
盐酸胍,加水到
450ml
。定容,抽滤,室温保存。
PPase
信息
1
.
PPa
se
是人类鼻病毒蛋白酶
Human rhinovirus
B
从
11
号氨基酸(
< br>G
P
N
T
E
F
A
L
S
L
L
R
)
,
N
端接入
为
BamH
,尾端为
EcoR
。所用载体为
pGEX4t
2
.
pGE
X4t-HR14
载体表达蛋白质序列
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHL
YERDEG
DKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKL
TQSMAIIRYIAD
KHNMLGGCPKERAEISMLEGA
VLDIRYGVSRIAYSKDFE
TLKVDFLSKLPEMLK
MFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFML
YDALDVVL
YMDPMCLDAFPKLVCFKKRI
EAIPQIDKYLKS
SKYIAWPLQGWQA
TFG
GGDHPPKSDLVPRGSGGGPNTEFALSLLRKNIMTITTSKGEFTGLGIHDR
VCVIPTHAQPGDDVLVNGQKIRVKDKYKLVDPENINLEL
TVLTLDRNEKFRDIRGFISEDLEGVDA
T
LVVHSNNFTNTILEVGPVTMAGLINLSSTPTNRMIRYDYATKTGQCGGVL
CATGKIFGIHVGGNGR
QGFSAQLKKQYFVEKQ
3
.
蛋白质参数
Number of
amino acids: 410
Molecular weight:
46403.5
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