-
PCR
的一般流程
(以
Taq
DNA
聚合酶为例)
一、
试剂和仪器
1
、
仪器:
PCR
仪、
移液器、
离心管和枪头
(
12
1
℃灭菌
20min
,
烘干)
、冰盒、板架、离心机。
2
O
:三蒸水
121
℃灭菌
20min
,
4
℃保存;
:含
Mg
,
10
p>
×,
-20
℃保存;
:
保存液为
25mM
,
使用前用
ddH
2
O
稀释为
2.5mM
并
分装,避免污染,
-20
℃保存。
5.
引物:引
物干粉在溶解前先
12,000rpm
离心
2min
,再
用
ddH
2
O
溶解至
10
μ
M
,
涡旋震荡使其充
分溶解,
-20
℃保
存;
6.
模板。
2+
DNA
聚合酶:
-20
℃保存。
二、
实验准备
1.
预订
PCR
仪,填写好使用时间;
2.
制冰;
3.
将所需试剂解冻、混匀、瞬离,置于冰上,模板要放在
精选
冰上解冻。
三、
步骤:
1.
设计实验,认真阅读相关试剂说明书。
2.
将离心管置于冰上,
按照如
下体系加入样品。
加样顺序
为:
ddH
2
O
→
Buf
fer/dNTP/
引物
/
模板。
p>
Taq
DNA
聚合酶反应体系(
25
μ
L
)
试剂
ddH
2
O
Buffer
(
Mg
,
10
×)
dNTP
(
2.5mM
)
p>
2+
用量(μ
L
)
18.375
μ
L
2.5
μ
L
2
μ
L
引物
(正向和反向,
10
μ
M
)
各
0.5
μ
L
模板
DNA
10
~10
copies
0.125
μ
L
2
5
Taq
DNA
聚合酶
*
*
注意:
加酶之前将酶拿出放冰上,
使用完立即放回冰<
/p>
箱。
3.
在离
心管盖上写好每个样品的编号,瞬离。
4.
< br>设置好
PCR
程序,
待反应温度
达到实验需要时,
将样品
放入
PCR<
/p>
仪,尽量放在中央的孔。
精选
5.
将
试剂放回原处,移液器调回最大量程,整理实验台。
6.
p>
反应结束后,及时停止
PCR
程序(不要停
在
4
℃太久)
,
取出样品,关好
PCR
仪。
四、
其它注意事项:
1.
正确使用移液器、离心机和
PCR
仪;
2.
手或移液器不要接触反应管或试剂瓶、
管的内壁、
盖内
侧;
3.
不使用枪头时,盖好枪头盒盖;
4.
枪头只能使用一次;
5.
合理设计实验,
使用适当的阴性对照很重要,
如:
使用
不加
DNA
的材料进行
PCR
扩增,以证明
缓冲液或其他试剂中
是否存在任何可影响
PCR
的污染物;
6.
如果一次实
验需做多管样品,尽量先配制
mix
,由于存
< br>在液体混合后的体积变化和挂液,计算
mix
用量要比实
际管
数多一些;
7.
反应在
PCR
仪进行期间,
最
好能检查一下程序是否在正
常运行,及时发现异常。
3.2
移液器的使用方法
1.
调节量程:轻轻旋转量程调节圈,注意不要超过量程。建
精选
议从高到低调节量程,
必要时,
可旋转量程调节圈稍超过
所需数值,再向回旋转,
移液可以更准确。
2.
装配枪头:轻
轻按压,将枪头盒上的枪头装配到移液器。
3.
吸液:按下操作键至一档(设定体积)
,将枪头垂直浸入
液体约
4mm
;让操作键慢慢复位,此过程中保持枪头浸入
深度,
防止吸入空气;
将枪头慢慢移出
液面,
并确保枪头
外壁无残留液体。
(
建议每个新枪头先经过一到三次的吸
液和放液来润湿,
有助于提
高移液准确度。
吸取大体积液
体时,将枪头保持浸入状态约
p>
3
秒钟,再移液。
)
A
B
图
3.2.1
移液器的吸液(
p>
A
)和放液(
B
)
4.
放液:
将枪头倾斜地紧贴管壁,
将操作键慢慢按向一档
(设
定体积)
,等待,直到不再有液体流出;将操作键按向二
< br>档(吹液)
,将枪头完全排空;仍然按住操作键,在管壁
上擦拭枪头;
在管外,
慢慢让操作键复位;
按下脱卸键卸
掉枪头。
精选
5.
其它注意事项:
(
1
)轻拿轻放,使用后调回最大量程;
(
2
)保持移液器洁净。
(
3
)与水
有很大物理性差异的溶液,或在移液器枪头和液
体间存在很大温差的溶液,
可能会导致移液不准,
要注意
检查移液体积。
3.3
PCR
反应原理及过程
3.3.1
反应原理
PCR
技术的基本原理类似于
DNA
的天然复制过程,其特
异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物,是利用
DNA
在体外摄氏
95
°高温时变性会变成单链,
p>
低温
(经常是
60
°
C
左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温<
/p>
度至
DNA
聚合酶最适反应温度(
72
°
C
左右),<
/p>
DNA
聚合酶
沿着磷酸到五碳糖
(5'-3')
的方向合成互补链(图
3.3.
1
)。
基于聚合酶制造的
PCR
仪实际就是一个温控设备,能在变性
温度,复性温度,延伸温度之间很
好地进行控制。
3.5.2
反应过程
PCR
由变性
--
退火
--
延伸三个基本反应步骤构成(图
3.3.2
):①模
板
DNA
的变性:模板
DNA
经加热至
95
℃左右
精
选
一定时间后,使模板
DNA
双链或经
PCR
扩增形成的双链
DNA
解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准
备;②模板
DNA
与引物的退火(复性):模板<
/p>
DNA
经加热变
性成单链后,
温度降至
55
℃左右,
引
物与模板
DNA
单链的互
补序列配对结
合;③引物的延伸:
DNA
模板
--<
/p>
引物结合物在
Taq
DNA
聚合酶的作用下,以
dNTP
为反应原料,靶序列
为模
板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模
板
DNA
链互补的半保留复制链,重复循环变性
--
退火
--
延伸
三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又
可成为下次循环
的模板。每完成一个循环需
2
~
4
p>
分钟,
2
~
3
p>
小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
精选
图
3.3.1
PCR
反应原理
精选
图
3.3.2
PCR
的基本步骤
3.4
几种常用
< br>PCR
方法
3.4.1
标准
PCR
(
Standard
PCR
)
该方法适用于扩增小于
p>
3000bp
的
DNA
序列。
建议体系:
Reaction Volume
100
μ
L
精选
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