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常见PCR方法整理

作者:高考题库网
来源:https://www.bjmy2z.cn/gaokao
2021-02-06 01:19
tags:

-

2021年2月6日发(作者:agonize)


PCR


的一般流程



(以


Taq


DNA


聚合酶为例)



一、



试剂和仪器



1



仪器:


PCR


仪、


移液器、


离心管和枪头



12 1


℃灭菌


20min



烘干)


、冰盒、板架、离心机。



2


O


:三蒸水

121


℃灭菌


20min



4


℃保存;




:含


Mg



10


×,


-20


℃保存;





保存液为


25mM



使用前用


ddH


2


O


稀释为


2.5mM



分装,避免污染,


-20

< p>
℃保存。



5.


引物:引 物干粉在溶解前先


12,000rpm


离心

2min


,再



ddH

< p>
2


O


溶解至


10


μ


M



涡旋震荡使其充 分溶解,


-20


℃保


存;



6.


模板。



2+



DNA


聚合酶:


-20


℃保存。



二、



实验准备



1.


预订


PCR


仪,填写好使用时间;



2.


制冰;



3.


将所需试剂解冻、混匀、瞬离,置于冰上,模板要放在


精选



冰上解冻。



三、



步骤:



1.


设计实验,认真阅读相关试剂说明书。


2.


将离心管置于冰上,


按照如 下体系加入样品。


加样顺序


为:


ddH


2


O



Buf fer/dNTP/


引物


/


模板。



Taq


DNA


聚合酶反应体系(


25


μ


L

< p>



试剂



ddH


2


O


Buffer



Mg



10


×)



dNTP



2.5mM




2+


用量(μ


L




18.375


μ


L


2.5


μ


L


2


μ


L


引物


(正向和反向,


10


μ


M





0.5


μ


L


模板


DNA


10


~10


copies


0.125


μ


L


2


5


Taq


DNA


聚合酶


*


*


注意:


加酶之前将酶拿出放冰上,


使用完立即放回冰< /p>


箱。



3.


在离 心管盖上写好每个样品的编号,瞬离。



4.

< br>设置好


PCR


程序,


待反应温度 达到实验需要时,


将样品


放入


PCR< /p>


仪,尽量放在中央的孔。



精选



5.


将 试剂放回原处,移液器调回最大量程,整理实验台。



6.


反应结束后,及时停止


PCR


程序(不要停 在


4


℃太久)



取出样品,关好


PCR


仪。



四、



其它注意事项:



1.


正确使用移液器、离心机和


PCR


仪;



2.


手或移液器不要接触反应管或试剂瓶、


管的内壁、


盖内


侧;



3.


不使用枪头时,盖好枪头盒盖;



4.


枪头只能使用一次;


< p>
5.


合理设计实验,


使用适当的阴性对照很重要,


如:


使用


不加


DNA


的材料进行


PCR


扩增,以证明 缓冲液或其他试剂中


是否存在任何可影响


PCR


的污染物;



6.


如果一次实 验需做多管样品,尽量先配制


mix


,由于存

< br>在液体混合后的体积变化和挂液,计算


mix


用量要比实 际管


数多一些;



7.


反应在


PCR


仪进行期间,


最 好能检查一下程序是否在正


常运行,及时发现异常。



3.2


移液器的使用方法



1.


调节量程:轻轻旋转量程调节圈,注意不要超过量程。建

< p>
精选



议从高到低调节量程,

必要时,


可旋转量程调节圈稍超过


所需数值,再向回旋转, 移液可以更准确。



2.


装配枪头:轻 轻按压,将枪头盒上的枪头装配到移液器。



3.


吸液:按下操作键至一档(设定体积)


,将枪头垂直浸入

液体约


4mm


;让操作键慢慢复位,此过程中保持枪头浸入


深度,


防止吸入空气;


将枪头慢慢移出 液面,


并确保枪头


外壁无残留液体。


( 建议每个新枪头先经过一到三次的吸


液和放液来润湿,


有助于提 高移液准确度。


吸取大体积液


体时,将枪头保持浸入状态约


3


秒钟,再移液。





A


B



3.2.1


移液器的吸液(


A


)和放液(


B




4.


放液:


将枪头倾斜地紧贴管壁,


将操作键慢慢按向一档


(设

< p>
定体积)


,等待,直到不再有液体流出;将操作键按向二

< br>档(吹液)


,将枪头完全排空;仍然按住操作键,在管壁


上擦拭枪头;


在管外,


慢慢让操作键复位;

按下脱卸键卸


掉枪头。



精选



5.


其它注意事项:




1


)轻拿轻放,使用后调回最大量程;




2


)保持移液器洁净。




3


)与水 有很大物理性差异的溶液,或在移液器枪头和液


体间存在很大温差的溶液,


可能会导致移液不准,


要注意


检查移液体积。



3.3 PCR


反应原理及过程



3.3.1


反应原理



PCR

技术的基本原理类似于


DNA


的天然复制过程,其特


异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物,是利用


DNA


在体外摄氏


95


°高温时变性会变成单链,


低温


(经常是


60


°


C


左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温< /p>


度至


DNA


聚合酶最适反应温度(


72


°


C


左右),< /p>


DNA


聚合酶


沿着磷酸到五碳糖


(5'-3')


的方向合成互补链(图


3.3. 1


)。


基于聚合酶制造的


PCR


仪实际就是一个温控设备,能在变性


温度,复性温度,延伸温度之间很 好地进行控制。



3.5.2


反应过程



PCR

由变性


--


退火


--


延伸三个基本反应步骤构成(图


3.3.2


):①模 板


DNA


的变性:模板


DNA


经加热至


95


℃左右


精 选



一定时间后,使模板


DNA


双链或经


PCR


扩增形成的双链


DNA


解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准

< p>
备;②模板


DNA


与引物的退火(复性):模板< /p>


DNA


经加热变


性成单链后,

< p>
温度降至


55


℃左右,


引 物与模板


DNA


单链的互


补序列配对结 合;③引物的延伸:


DNA


模板


--< /p>


引物结合物在


Taq


DNA

< p>
聚合酶的作用下,以


dNTP


为反应原料,靶序列 为模


板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模



DNA


链互补的半保留复制链,重复循环变性


--


退火


--


延伸

< p>
三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又


可成为下次循环 的模板。每完成一个循环需


2



4


分钟,


2



3


小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。




精选





3.3.1 PCR


反应原理




精选





3.3.2 PCR


的基本步骤





3.4


几种常用

< br>PCR


方法




3.4.1


标准


PCR



Standard PCR




该方法适用于扩增小于


3000bp



DNA

序列。



建议体系:



Reaction Volume




100


μ


L



精选

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