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代谢组学概述
代谢
组学
(metabonomics/metabolomics)
是效仿基因组学和蛋白质
组学的研究思想,
对生物体内所有代
谢物进行定量分析,
并寻找代谢
物与生理病理变化的相对关系的
研究方式,
是系统生物学的组成部分。
其研究对象大都是相对分
子质量
1000
以内的小分子物质。先进分析
< br>检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究
的基本方法。<
/p>
一:代谢组学分析流程
一般来说,代谢组的分析流程有:首先将代谢组分进行预处理,
预处理的方法由测量分析方法决定,
如使用质谱方法分析,
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则需要预
先对代谢组分进行分离和离子化。
接着,
再对预处理后的组分进行定
性和定量分析。
预处理中,
常用分离方法包括:
< br>气相色谱
(
Gas
chromatography
,
G
C
)
,
高效液相色谱
< br>(
High performance liquid
chromatography
,
H
PLC
)
。
气相色谱具有较高的分辨率
,
但需要对代谢组分进行气化,
并且对组
分分子质量有一定的限制。
高效液相色谱也在代谢组分析中被广泛地
< br>使用,
因其在液相中对代谢组分进行分离,
因此不用对组
分进行气化,
相较气相色谱具有测量范围更广,更灵敏的优点。此外,毛细管电泳
法(
Capillary electrophoresis
)
也可以对代谢组分进行分离,其应用较
少,但
在理论上其分离效率比高效液相色谱法高。
在预处理时,常常会加入内参(
internal stand
ards
)
,以方便后续
对样品的质量
进行监控和对比,
由于不同的实验批次、
样品顺序对后
续测量也有一定对影响,
因此,
还会加入空对照
和混合样品对照来进
行质量监控。
对
不同的代谢组分进行定性和定量分析的方法包括质谱分析法
(
M
ass spectrometry
,
MS)
和核磁共振谱
(
Nuclea
r Magnetic Resonance
Imaging
,
< br>NMR
)等。其中,质谱分析法具有灵敏度高,特异性强等
优点,被广泛地应用于检测代谢组分,可以对经过分离、离子化处理
后的代谢组分进行
定性和定量。
离子化的方法包括:
大气压化学电离
(
Atmospheric-pressure
chemical
ionization
,
APCI
)
,
电子电离
(
Electron
ionization
,
EI
)
,
以及电喷雾电离
(
Electrospray ionization
,
ESI)
等,需要根据不同的分离方法选用。例如电喷雾电离,常用于被
液相色谱进行分离的组分
。
但由于质谱并不能直接对生物溶液或组织
进行检测,其应用一
直受限。为了提高原有的质谱分析法的灵敏性,
使样品的准备简单化,
< br>减少背景的影响,
一些新的质谱相关技术得以
产生。
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这些技术包括:
二次离子质谱
(
Secondary-ion mass spectrometry
,
SIMS)
和纳米结构引发器质谱(
Nanostructure-Initiator
MS
,
NI
MS)
,
属于去吸附/离子化方法,这两种技术都不依赖基质。
其中,
SIMS
使用高能离子束使样品接触表面解吸,
具有高空间分辨率的优势,
与
质谱串联后是用于
器官/组织造影的有力技术。
而
NIMS
可用于小分
子
的
检
< br>测
。
基
质
辅
助
激
光
脱
附
电
离
(
p>
Matrix-assisted
laser
desorption/ionization
,
MALDI
)是一种较为温和的离子化方法,可
以
得到用常规离子化方法容易解离为碎片的一些完整大分子质谱信
息,如
< br>DNA
、蛋白质、多肽和糖等。解析电喷雾电离(
Des
orption
electrospray
ionization
,
DESI)
是一种直接电离技术,可以与质谱串
联后,
直接对大气条件下的样品分析。
其原理是利用快速移动的带电
溶液流来提取接触表面的样品,可用于取证分析、药物、植物、生物
组织、高聚物等的
分析。激光烧蚀电喷雾电离(
Laser
Ablation
Electrospray
Ionization
,
LAESI)
是一种结合了中红外激光烧蚀和二
次电喷雾电离的直接电离技术,
< br>可用于广泛的样品,
包括植物、
组织、
< br>细胞,甚至是未经处理的生物溶液如血液、尿液等。已被用于食品监
管、药物监管
等领域。核磁共振谱不需要预先对代谢组分进行分离,
相较质谱而言,核磁共振谱具有结
果可重复性好,样品准备较简单,
不用预先分离,对样品破坏性低等优点,尽管灵敏性相
较质谱低(存
在争议,部分学者认为这是样品预处理工作流程不正确造成的)
,但
因其易于使用,因此应用也十分广泛。
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除此之外,
其他的检测方法还有:
离子迁移
率光谱
(
Ion-mobility
spectrometry
,
IMS
)
是一种基于离子化的分子在在气相载体中的迁移
来分离和分析
这些分子的技术,具有很高的灵敏度,可以单独使用,
也可以和质谱、
< br>气相色谱或液相色谱串联使用。
电化学检测串联高效
液<
/p>
相
色
谱
(
electrochemical
detection
techniques
coupled
with
high-performance
liquid
chromatography
,
HPLC-ECD)
可以用于测量<
/p>
复杂基质中低含量的组分,具有易用性、灵敏性、选择性,已被用于
临床研究、
食品检测、
药物检测等领域。
拉曼光谱
(
Raman spectroscopy
)
基于振动光谱学,
能够检测化合物结构和其
微小变化,
具有不破坏样