关键词不能为空

当前您在: 主页 > 英语 >

标记活细胞内蛋白质的化学标签

作者:高考题库网
来源:https://www.bjmy2z.cn/gaokao
2021-01-29 09:56
tags:

-friction

2021年1月29日发(作者:flocked)









< br>文



论文题目:标记活细胞内蛋白质的化学标签


学生姓名:



号:


专< /p>


业:


指导教师:







院:


























冉珊珊






















2




















应用化学























李平



教授















化学化工与材料科学学院








2014



5


月< /p>


9








毕业论文(设计)内容介绍



论文(设计)







标记活细胞内蛋白质的化学标签



选题时间










完成时间



2014.5.9


论文(设计)



字数



9805


标签、蛋白、多肽、标记、荧光团、选择性、成像



论文(设计)题目的来源、理论和实践意义:




题目来源:学生自主选题,教师指导。



理论和实践意义:


随着科学技术的发展,


活细胞内蛋白质标记 技术在不断提


高,


与活细胞内蛋白质标记课题相关的文章也越来 越多,


但这类文章大都只对蛋


白质标记课题的一个方面或几个方 面进行了的阐述,一些综述性的文献相对缺


乏。


基于这种现状,


我查阅了许多文献,


发现其中一篇文献对活细胞内蛋白质标


记技术阐述的较为全面、


条理和清晰,


所以 我对这篇文献进行了翻译,


并进行了


分析和整理。


我相信,


这样的一篇综述性质的文章一定能够为研究人员提供一个

< p>
比较清晰明确的学习和研究思路。



论文(设计)的主要内容及创新点:



主要内容:


本文主要讲述了本世纪以来,


在标记活细胞内蛋白质 技术中,



荧光蛋白之外的几种主要的化学标签,以及化学标签 的应用。



创新点:


化学标签通过让具 有较高的光子输出和专一性的荧光团掺入,


提供


了比荧光蛋白更 多的优势。


除此之外,


化学标签还有更巨大的潜力。

< p>
在未来十年,


或许化学家能够利用这些化学标签创造全新的光谱学,


以揭示活细胞背景下的生


物学机制。



附:论文(设计)



本人签名:


冉珊珊


2014



5



9










目录



摘要


......................... .................................................. .......................................... 1



Abstract ................. .................................................. ............................................ 1



一、引言



................................................. .................................................. .......... 2



二、化学标签的类型



.


............................................. ........................................... 3



(一)基于蛋白质的化学标签


< /p>


.


............................ ...................................... 3



(二)基于肽的化学标签



.


.............................. ............................................ 5



三、化学标签的应用


< p>
.


................................ .................................................. ...... 6



(一)化学标签开启高分辨率成像



.


....................................... ................... 7



(二)化学标签在细胞成像中应用的主题和变化



.


................................. . 9



(三)化学标记是生物素


/< /p>


链霉亲和素在体外应用的替代品


...............


10



四、化学标签的展望



.


............................................. ......................................... 11



五、致谢


................................................ .................................................. ......... 11



参考文献



....................................... .................................................. .................. 11









标记活细胞内蛋白质的化学标签



冉珊珊




(山东师范大学化学化工与材料科学学院)



摘要:




上个世纪,化学方法应用于选择性地标记试管中的蛋白质,对体外生物物理学起


到了重 要作用,在面临理解本世纪活细胞中蛋白质如何运作这一挑战时,化学标记技


术仍然可以 起到突破性作用。利用化学标记技术,目的蛋白附着到一个多肽,而不是


一个荧光蛋白。


随后用有机荧光团或其它探针修改多肽。


FlAsH

< p>
肽标签于


1998


年首次


报道。自那时以来,更精致的蛋白质标签,例如


TMP



SNAP


标签,提高了选择性,


并使细胞内蛋 白质以高信噪比成像。


进一步改进仍然需要实现强大的荧光基团直接掺

< br>入,但酶介导的化学标签能够克服选择性标记短肽标签的难题。这篇报告中,我们专


注于化学标记在研究活细胞内蛋白质工作方式的开发和应用。


因此,

< br>对于不同的化学


标记策略和技术,


我们重视标记反应足够 的选择性和荧光探针对细胞内蛋白质高信噪


比成像。



关键词


:


蛋白、多肽、标记、荧光团

< p>


Abstract:





Chemical methods for selectively labeling proteins in the test tube significantly impacted


in vitro biophysics in the last century, and chemical tagging technologies are now poised to


provide a breakthrough to meet this century's challenge of understanding protein function


in


the


living



chemical


tags,


the


protein


of


interest


is


attached


to


a


polypeptide


rather than an FP. The polypeptide is subsequently modified with an organic fluorophore or


another probe. The FlAsH peptide tag was first reported in 1998. Since then, more refined


protein


tags,


exemplified


by


the


TMP-


and


SNAP-tag,


have


improved


selectivity


and


enabled


imaging


of


intracellular


proteins


with


high


signal-to-noise


ratios.


Further


improvement is still required to achieve direct incorporation of powerful fluorophores, but


enzyme-mediated chemical tags show promise for overcoming the difficulty of selectively


labeling a short peptide tag. In this Account, we focus on the development and application


of chemical tags for studying protein function within living cells. Thus, in our overview of


different


chemical


tagging


strategies


and


technologies,


we


emphasize


the


challenge


of


rendering the labeling reaction sufficiently selective and the fluorophore probe sufficiently


well behaved to image intracellular proteins with high signal-to-noise ratios.



Key Words: protein,



polypeptide,



labele,



fluorophore



1



一、



引言



在上个世纪,

< br>用有机荧光和其他生物物理探针进行位点特异性标记蛋白的化学方


法显著影响体外 蛋白质的基础研究。


尽管事实上,显微注射技术在技术上需要损害细

胞,但是这些化学探针实际应用中显示,显微注射进细胞的纯化蛋白质的化学修饰,


仍然应用于活细胞成像。


1


体外化学探针可以被设计的对胱氨酸 和赖氨酸残基选择性


地发生反应,因此在体外,标记纯化的蛋白质很有效,然而,细胞中 存在的大量的蛋


白质和其它能够反应的一系列物质根本就没有所需要的能够被选择性标记 的特定的


蛋白质。



(图


1



< /p>


1994


年,活细胞成像随着一种有选择性的、遗传性的蛋白质标 签——荧光蛋白



fps


)的引入而有 所突破。


2,3


绿色荧光蛋白(


GFP


)最初来自


ia


,是一种


238


个氨基酸的蛋白质,通过位于第


11-



β


-


位的中心的丝 氨酸、酪氨酸和甘氨酸残基的


重排和氧化,折叠后自发形成荧光发色团。


4,5


由于这些原始报告,自然存在和人工合


成的荧光 蛋白在各个光谱范围都能被充分利用,


为提供给细胞生物学家更丰富的试剂


6,7


增加了希望和更多可能。


荧光蛋白标记通常用 于观察蛋白质在活细胞中表达的时间


和位置的表达,经常提供显著洞察力。然而,荧光蛋 白对更复杂的生物物理和机理研


究有局限性。


4,6,8


作为


?


30kD


的蛋 白质,荧光蛋白可以破坏集合、互动或标记蛋白的


功能


;


荧光蛋白通常具有广阔的吸收和发射光谱,使其在技术上要求监测甚至只是三

< br>种不同的蛋白质同时使用多色成像;


7


荧光蛋白能遭受低 聚和


/


或缓慢的折叠和发色团


的成熟< /p>


;


荧光团的专业性能难以操纵,因为它是荧光蛋白固有的序列


;


更重要的是,在



2



光子输出方面(经常测量亮度和 耐光性)


,关键是单分子分辨率,在这一点上,没有


一种荧光蛋 白可以跟最合适的有机荧光团、


更少的纳米颗粒或其他新兴的化学探针媲


美。因此,化学标签为已开发的标记蛋白质提供了另一种可以替代的直接在活细胞中

得到的化学探针。



二、化学标签的类型



用化学标签标记 靶蛋白,而不是用荧光蛋白标记,这种靶蛋白用多肽标记,也就


是随后经过改良的有机荧 光团。


技术上,用化学标签标记靶蛋白与用荧光蛋白标记靶


蛋白 是非常类似的:


目标蛋白质和多肽的标签间质粒编码的融合是使用标准的分子克


隆技术建构并导入到所希望的细胞中的。


有机荧光团扩散到细胞中,然后 通过特异性


结合或与多肽标记相偶联,并培养细胞。因此,化学标签仍然保留用荧光蛋白 实现蛋


白质标记的特点,


但是通过基因编码,但提供更小更可靠 的标签以及有较高的光子输


出和定制功能有机荧光团的模块化的使用。

< br>


第一份关于在活细胞中用有机荧光团标记蛋白质的荧光蛋白的替代品的报告钱< /p>


9


学森和他的同事在


1998

< p>
年发表的



FLASH




报告中指出,


Flash

< p>
是理想的化学标签,


短短


15

个氨基酸的多肽标签,中心是两端分别与含砷的荧光素配合的四半胱氨酸



CCXXCC



,荧光性增强基于结合了多肽标 签(图


1A



。迄今为止,一些


l


两端含


砷的荧光团和相对应的四半胱氨酸(


TC


)的标签的已发布,


10-12< /p>


其中最初的绿色荧光


FlAsH


和红色荧 光


ReAsH


应用的最频繁。尽管其优雅的设计,技术实际上遭 受细胞


中含有丰富硫醇的生物分子的非特异性标记、两端含砷配体的毒性和标记的条件。


13


然而,受惠于它的体积小,往往是唯一可行的标记被


250


个氨基酸荧光蛋白损害的蛋


白质或复合 物的标签。


(通过


250


个氨基酸荧光 蛋白标记被损害的蛋白质或复合物的


标签,


Flash


往往是唯一可行的。


)并且


FlAsH


被广泛报道,也使许多实验成为可能。


14



(一)基于蛋白质的化学标签



为了克 服短肽标签的选择性限制,引入了以蛋白质为基础的化学标签,以允许靶


蛋白能被一个蛋 白质受体或酶标记,它随后可以被有细胞渗透性的有机配体


-


或 底物


-


探针异源二聚体标记。下面是几个关于这些蛋白质受体< /p>


-


配体或酶


-


底 物标签的关键性


设计问题。一,也许最重要的是,有机荧光配体或底物必须对内源性蛋白 质或其他生


物分子有较强的细胞渗透性和非特异性结合,


或者同 样重要但比较少提的是,如果不



3



这样就会分割细胞内特定的细胞器。


二,


该配体或底物衍生物的合成应该是最直接的,


并且是对受体结合或酶的功能破坏性最小 的。


三,


蛋白质受体或酶应该要小的单分子,

< br>并且应该几乎不受生物研究过程中的微小干扰。四,该蛋白质标签和配位体


/


底物


-



针之间的 标记反应应是快速和近乎定量的。


迄今为止,蛋白质标签优于其他化学标记


的优点是他们对细胞内的蛋白质高信噪比地成像有足够的选择性和高效性。



在与


Sheetz


组合作的过程中,我 们的实验室利用二氢叶酸还原酶(


DHFR


)和叶


酸类似物之间的高亲和力的相互作用来标记活细胞中的蛋白质。


简单地说,我 们用大


肠杆菌二氢叶酸还原酶(


eDHFR

)标记靶蛋白。简单地说,我们用大肠杆菌二氢叶酸


还原酶(


eDHFR


)标记靶蛋白。因为


eDHFR

< br>以高亲和力(


1nMKD


)和高选择性(哺


乳动物


DHFRs


的亲和力


KD>1


μ


M


)与三甲氧苄氨嘧啶(< /p>


TMP


)结合。


TMP

< br>探针异


源二聚体经过十分钟的解离半衰期,然后与


eDH FR


结合成非共价键,这样该


eDHFR


标签就被相近化学计量浓度的


TMP


探针异源二聚体标记(图


1B




19 ,30



31


TMP-


探针


异源二聚体具有优异的细胞渗透性和溶解性能,正是这种特点使得


TMP


在临床上可


以作为一种抗生素。


正如预期,


基于高分辨率的结构和构效关系的数据,

市售的


TMP


可以与


eDHFR< /p>


高亲和力结合,


因此只需要对其施加


eD HFR


这一微小的干扰,


就可以


改变对 甲氧基的位置,这使得合成


TMP-


探针标记非常简单。作为含 有


159


个氨基酸


的,单链的,表达好 的蛋白质,


eDHFR


大约是


FP


的三分之二大小,没有齐聚和表达


的问题,折叠迅速,绕开了生色团 成熟半衰期的难题。


32,33


在众多化学标签中,

< p>
TMP


标签脱颖而出是因为使细胞内蛋白在活细胞中成的像具有较高的分辨 率。



我们使用


TMP


标签努力描绘哺乳动物细胞中黏着斑复合体的个别蛋白的图像,


这些努力告诉我 们,一旦


TMP-


探针标签在细胞内,那么标签的关键性能问题 就不是


TMP-


探针标签细胞的通透性,而是

< br>TMP-


探针标记物的溶度。重要的是,通过保护基


团和 连接器的优化,我们获得了能把细胞区室划分的很小的非特异性的富含脂质的


TMP-< /p>


荧光标签,


因此可以把图像放的更大,


胞 质蛋白的扩散的信噪比更高。


19


能够对


胞内蛋白质成像的


TMP-


荧光团调色板的已从荧光素为基础 的绿色和人造红色色素扩


展到包括一个远红外光控


Atto-6 55


,双光子荧光


BC575


和镧系元 素的探针。


20,34,35



要的是 通过细胞生物学家和生物物理学家


(即不专门从事有机合成的实验室)

< br>的采用,


将源自活性片断的


TMP-

标签可作为柔性链市售。



值得注意的是,


TMP


标签通过在


eDHFR


的适当位置上安装独特的


Cys


残基,现


在也已经呈现共价,它可以与通过由接近引起的经典的


Michael


加成反应而加入到



4


< /p>


36


TMP-


探针分子的潜在的丙烯酰胺 亲电子试剂发生反应。


虽然经过优化,


第一代的共



TMP-


标签经历了快速,定量的共价标签(体外


T1/2


?


50


分钟)并让位于原子核的


eDHFR


在活的

< br>NIH3T3


细胞中成像。


但这项工作表明,

< p>
基于高亲和结合的化学标签的


优势,是它不要求高浓度的配体探针与以酶为 基础的化学标记的必要的共轭。其中


KM


的变化范围一般从微摩 尔至毫摩尔,导致来自未结合的荧光团的高背景噪声,迫


使大量的洗涤步骤。

< p>
29,37



另一种可以替代以蛋白质为基础的化 学标签的策略,



SNAP-


标签”采 用修饰过


的邻位鸟嘌呤


-


荧光团异源二 聚体标记融合到人类的邻位烷基鸟嘌呤


-DNA-


烷基转移


酶(


hAGT



, 一个


20kD


的单体


DNA

< p>
可以修复蛋白,通过半胱氨酸残基烷基化的单


个转换,自然地使邻位烷基鸟 嘌呤脱烷烃后的残基进入


DNA(



1 C)



37


能够迅速反


应的


SNAP-


标签的变体已经设计出来,

< p>
以最大限度地减少内源性哺乳动物高级颗粒技



( AGT)


的背景标记。


38


赫然,正交


AGT


选择性地使用胞嘧啶荧光团作为底物,它被


称为


CLIP-


标签的变体,也已经演变而来,尽管 它需要进一步优化的像


SNAP


标签那


37,39


样强劲。


许多各种不同的


S NAP



CILP-


荧光团购自


NewEnglandBiolabs


公司,



些荧光团中的一些已经被证实能够在活细胞里面起作用(表


1



。同样,


Promega

< p>
公司


开发了一种以带有自杀底物的工程脱卤素酶为基础的的共价化学标记,



Halo


标签”


26,28


已经证明在体外是有效用的标记,但报告表明 它可能要面临细胞内的效率和选择


性问题。


40



新的基于蛋白质的化学标记的不断推出,


但现在大多 尚未充分核实这些化学标记


的实际效用,特别是需要对细胞内蛋白质标记进行艰巨的工作 。这些标签包括与自杀


底物反应的角质酶变异体


;


41


荧光标记,


其中


β


-


内酰胺酶的变异体取代了来自头孢烯自


杀 底物淬灭集团


;


42,43


非共价标签 ,


其中他克莫司的合成配体



SLF< /p>



与结合蛋白结合。


44



(二)基于肽的化学标签



化学标记,它将可能替换蛋白质标签,这样就可以利用短肽标签干扰蛋白质的相


互作用和 过程功能。


现在该领域的挑战是从概念上制定新的化学修饰的策略,用可以


克服当前选择局限性的荧光团对短肽进行化学修饰,


这样短肽标签可以被许多 存在于


活细胞中的其他活性分子识别。



汀实验室首创了用有机分子修改短肽对天然酶进行荧光标记的重新设计。


45


这些



5



化学标记中最先进的是大肠杆菌连接酶(


BirA



,其天然功能是含有肽识别基序的蛋


白的生物素酰化,用于 用生物素类似物标记一个含有


15


个氨基酸的短肽标签,随后< /p>


用荧光团修饰(图


1D




45,46


至今,大肠杆菌连接酶(


BirA


)一直抵制直接掺入荧光


共轭的生物素剧烈的 修改。所以,细胞内的蛋白标记,仍然是困难的,因为生物素类


似物和荧光团间的第二步 反应在微摩尔浓度典型细胞中是缓慢和选择性不完全的。



近一 个令人振奋的消息说明了它的潜力,


硫辛酸连接酶变异体进化到能直接使用香豆


素衍生物,虽然香豆素本身并不是细胞成像的一个理想的荧光团。




(表


1



< /p>


多种酶介导的肽标记的现已报道,包括由


phosphopant etheine


转移酶(


PPTase



修改的酰基载体蛋白(


ACP


)为基 础的标签


;



47

通过分选酶修改的


6


个氨基酸的


5 0



;


48,49

Bertozzi


教授等人报道甲酰产生基于酶的标签。


迄 今为止,


上述所有这些肽标


签被证明只能在细胞表面起作用。< /p>



除酶介导的肽标签之外,正在探索其他更适合短肽标签的方法。 类似


Flash


的标


51


签,


tetraserine


肽标签被证明能与荧光 双硼酸衍生物结合。


最近的一次报告中,


Chang

< p>
和同事开发了一种肽标签,这种肽标签与氟硼吡咯(


BODIPY


)荧光发生


Michael


< br>成。


52


受到流行的用于蛋白质纯化的多组氨酸标签的启 发,各种金属螯合肽已被改编


53-57


的适合蛋白质标记。< /p>


用一种有趣的方法,


诺兰和同事培养了一个


38


个氨基酸的肽,


其能与德克萨斯红荧光团高亲和力结合。


58


在体内具有序列特异性的蛋白酶产生的氨

< br>基末端的半胱氨酸(


Cys


)残基已被硫酯标记,类似于 天然的化学连接。


59


虽然这些


不同的 策略正处于发展的早期阶段,


但这些化学策略说明可以在活细胞中开发出新东

< p>
西,这不仅对活细胞成像有显著影响,对更广泛的合成生物学也有重要意义。



三、化学标签的应用




6



化学标签已经发展的比较成熟,


他们的价值的衡量现在是在活细胞中他们有能力


在活细胞中实验 ,而这用荧光蛋白(


FPs


)是很难或没有其他可能。因为与荧 光蛋白



FP


)相比,


60,61


最好的有机荧光团发射约


10


倍的光子,而且它们在利用化学标签


对活细胞内单分子成像方面有重要作用。 此外,由于它们的模块化设计,化学标记不


限于荧光标记,


并且 可以是创造性增选为用于各种活细胞中的应用工具,在体外也是


如此。

< br>在这里,


我们重点强调化学标签在解决生物机制问题的众多应用中的几个应用,< /p>


来说明一些化学标记的与众不同的独特功能。







2




(一)化学标签开启高分辨率成像



在 最近的结果中,我们利用


TMP


标签和


SNAP-


标签,使酵母细胞提取物中的剪


接体的单分子成像( 图


2



,该实验不可能低于光子输出的 帧数。


62


尽管化学标签对理


解该机制 有重要作用,并且通过这个机制前


mRNA


拼接为成熟的


mRNA


,但该剪接


体难以研究,

< p>
因为它是蛋白质和


RNA


的复合

< br>2-3MD


机器,


并且不能在体外将纯化的


成分重组。该


TMP-



S NAP-


标签允许对细胞提取物剪接的小核核糖核蛋白成分


(s nRNP)


用具有高的光子输出的染料直接标记,


并且像在特定 的前体


mRNA


上组装一


样成像。接下 来的进展将有


2-3


正交的、高光子输出的化学标记,使细胞内 单分子成


像(在这项工作中所使用的花青染料需要一个无氧环境)





7



(图


3



< /p>


同样,高光子输出的化学标记开始影响到



超分辨率




SR

< br>)成像技术,这种成像


技术能够突破衍射壁垒,能使荧光成像技术达到天然蛋白质 的纳米尺度(图


3




63-65


随机


SR


成像技术 ,包括


PALM


(光激活定位显微术)和


STORM


(随机光学重建显


微镜技术)

取决于具有高光子输出的光控荧光基团,这使全部荧光团中部分集合的位


置能够随着 时间的推移精确测定。


20,66,67


直到最近,

< p>
SR


成像仍然通常依赖光活化的荧


光蛋白(


FPs



,但这限制了光子输出和调色板,或 者依赖与有机荧光团共轭结合的抗


体,这提供了更高的分辨率和更多的颜色但与活细胞不 兼容。化学标签有潜力结合这


两种相对比的标记方法;这两种标记方法是基因编码的这样 它们就能与活细胞兼容,


并且它们是模块化的这样它们就能允许光开关的高光子输出有机 荧光的使用。


为了把


这种潜力变成现实,这一年多来,


Sauer


等人发现细胞的还原环境能催化高光子输出

< br>Atto


有机荧光团的光控,这种有机荧光团非常适合直接的随机光学重建显微镜 技术


(dSTORM)


成像,


68


基于这些发现,我们论证了被


TMP-Atto-655

< p>
20


标记的


H2B


的动态



8



dS TORM


成像理论。重要的是,我们实现了超常的空间(


?


20


纳米)和时间(


?

10


秒)的分辨率成像,而这用荧光蛋白是不可能的。




(图


4




(二)化学标签在细胞成像中应用的主题和变化



不同于荧光蛋白,化学标签不局限于传统的荧光成像。例如,在经典脉冲追踪术


标记的创新性应用中,连接蛋白(


Cx43


)形成细胞之间的 间隙连接,


Cx43


组装过程


中,相关 的的荧光性和电子显微镜(


EM


)都用到了

FLASH


标签(图


4




Cx43


蛋白


是一种 小分子蛋白,形成紧密的低聚物,充满质膜的缝隙连接。示踪的


Cx43


蛋白是



Flash


(脉冲信 号)标记的,然后一段时间后,用


ReAsH


(追踪信号)追踪 。根据


荧光性和电子显微镜明确显示,


开始时,


最初的


Cx43s


被添加到间隙连接斑空斑的边


缘。


14




9




(图


5



< /p>


酶介导的肽标签已经被改造为细胞内吞作用的唯一报告者。


为了监 测细胞表面受


体的内化,


有必要差异化地标记细胞表面和那些内 化到细胞里面的受体,这用荧光蛋


白(


FPs

< br>)是很困难的。然而,使用化学标签可以检测内化受体,非细胞渗透性的荧


光团到 达细胞表面后,选择性地标记细胞表面上的受体,随后荧光熄灭。生物素连接


酶(


BirA



/


链霉亲 和素标记技术已经被应用于描绘低密度脂蛋白



LDL


)受体的内吞


作用,表明在


LDL


配体存在和不存在的情况下,


LDL


受体都被内化低 聚物(图


5




69


化学标签的创意拓展似乎将会没有限制。


TMP


标签,


SNAP-


标签和

FLASH


标签


都被用于发色基团辅助激光失活(


CALI



,利用此技术,激光照射发色基团使 其吸收


能量


,


继而产生大量的活性氧< /p>


,


造成目标蛋白局部破坏而失去活性。


1 8,25,70



SNAP-



CLIP-


标签已被结合使用,以检测蛋白质


-


蛋白质相互作用


;


71


SNAP-



CLIP-


标 签已被


结合使用,以检测蛋白质


-


蛋白 质相互作用


;


四半胱氨酸


-FLASH


标签的变异体已被设


计来展现蛋白质折叠和关联。


72


可以说,化学标签都只是专门用于荧光成像“二聚化

的化学诱导剂”



CID



,因此,可以做出如下推论,化学标签可以被用作


CID


的多种


应用。


73



(三)化学标记是生物素


/


链霉亲和素在体外 应用的替代品



虽然解释侧重于活细胞成像,

< br>应当指出的是,


化学标记也可以看作是现代体外工


程生物 素


/


链霉亲和素的替代,


,它有作为单 体的好处,可能是共价的,并且更容易可


逆。


28


化学标签(特别是


Halo


标签)已用作生物素


/


链霉亲和素蛋白质的纯化和固定


化的正交 替代


;


化学标签可以标记敏感大分子复合物中的蛋白质


;


并且在材料化学中,



10



化学标签可用于表面图案化, 虽然这些体外应用的全面调查超出了它的解释范围。


74



四、化学标签的展望



随着化学标记技 术从验证性原则的阶段转变到被那些对研究细胞复杂环境中的


蛋白质功能感兴趣的细胞生 物学家和生物物理学家广泛的采用,


急切的需要多种化学


标签在 活细胞中进行彩色成像。也许令人惊讶,


虽然现在杂志上会定期报道新的化学

< p>
标签,但是这个领域仍然需要额外的化学标签来选择性标记细胞内的蛋白。此外,虽


然事实上任何已知的荧光蛋白和现在的一整套庞大的化学标签共轭结合,


但是仍 然很


少有报道可以在细胞内工作的高光子输出荧光标签。



另一个重要的进步将是实现化学标记的潜力,大大降低标签的大小。最近的结果


很吸引人,


显示将有可能使现有的酶介导的肽标记在活细胞内部产生效用。< /p>


我们认为,


非天然氨基酸突变有可能提供一个突破,使有机荧光作 为氨基酸侧链直接掺入,



1



提高转译机器底物专一性以利于引入高光子输出的、红移的有机荧光团(


2


)克服荧


光氨基酸无处不在的掺入以响应转录过程中存在的 众多终止密码子。



最后,


虽然化学标 签通过掺入具有较高的光子输出和专一性的荧光团模块(例如


光控荧光团)提供了比荧光 蛋白(


FPs


)更多的优势,这些化学标签除引入荧光团探


针之外,还有巨大的引入其它探针的潜力未开发。在未来十年,如果化学家能够利用


这些模块化的标签创造全新的光谱学,以应对理解在活细胞背景下生物学机制的挑


战。



五、致谢


< p>
在此论文撰写过程中,要特别感谢我的导师李平老师和肖海滨师哥的指导与督


促,同时感谢他们的谅解与包容。从论文的选题到资料的搜集直至最后设计的修改的


整 个过程中,


花费了他们很多的宝贵时间和精力,


在此向老师和师 姐表示衷心地感谢。


他们严谨的治学态度,


开拓进取的精神和高 度的责任心都将使学生受益终生。还要感


谢和我同一设计小组的几位同学,


是你们在我平时设计中和我一起探讨问题,并指出


我设计上的误区,


使我能及时的发现问题把设计顺利的进行下去,没有你们的帮助我


不可能 这样顺利地结稿,在此表示深深的谢意。



本文参考了大量的文献资料,在此,向各学术界的前辈们致敬。



参考文献:




11



1


Danuser,


G.;


Waterman-Storer,


C.


M.


Quantitative


Fluorescent


Speckle


Microscopy


of


Cytoskeleton Dynamics. Annu . Rev. Biophys. Biomol . Struct.2006 , 35 ,361



387.


2 Chalfie, M .; Tu, Y. Euskirchen, G. Ward , W. W. Prasher, D. C . Green



Fluorescent Prote in as a Marker for Gene Expression. Science 1994 , 263, 802



805.


3 Heim, R.; Prasher, D. C.; Tsien, R. Y. Wavelength Mutations and Posttranslational


Autoxidation


of


Green


Fluorescent


Protein.


.U.S.A.1994


,


91


,12501



12504.


4 Tsien, R . Y. The Green Fluorescent Protein. m.1998 , 67 , 509



544 .


5 Ormo, M.; Cubitt, A. B.; Kallio, K.; Gross, L. A.; Tsien, R. Y.; Remington, S. J. Crystal


Structure


of


the


Aequorea


Victoria


Green


Fluorescent


Prote


in


.


Science


1996


,


273,1392



1395.


6 Giepmans, B. N.; Adams, S. R.; Ellisman, M. H.; Tsien, R. Y. The Fluorescent Toolbox


for Assessing Protein Location and Function. Science 2006 , 312, 217



224.


7 Shaner, N. C.; Steinbach, P. A.; Tsien, R. Y. A Guide to Choosing Fluorescent Proteins.


Nat. Methods 2005 , 2, 905



909.


8 Shaner, N. C.; Patterson, G. H.; Davidson, M. W. Advances in Fluorescent Protein


Technology.J. Cell Sci. 2007 , 120, 4247



4260 .


9 Griffin, B. A.; Adams, S. R.; Tsien, R. Y. Specific Covalent


Labeling of Recombinant


Protein Molecules inside Live e 1998 , 281, 269



272.


10 Adams, S. R. Campbell , R . E .; Gross, L. A.; M arti n, B. R. Walkup, G. K. Yao,


Y.; Llop is , J .; Tsien, R. Y. New Biarsenical Ligands and Tetracysteine Motifs for Protein


Labeling in Vitro and i n Vivo: Synthesi s and Biological Applications. J. Am. Chem. Soc.


2002 , 124,6063



6076.


11 Bhuni a, A. K. Miller, S. C . Labeling Tetracyste in e-Tagged Proteins with a Splash of


Color : A Modular Approach to Bis- Arsenical Fluoro phores. ChemBioChem2007 , 8, 1642



1645.


12 Cao, H.;Xiong, Y.;Wang,T.;Chen,B.;Squier, T. C.;Mayer,3-Based


Biarsenical Fluorescent Probe Targeted to a Complementary Binding Peptide.J. Am. Chem.


Soc. 2007 , 129, 8672



8673.



12

-friction


-friction


-friction


-friction


-friction


-friction


-friction


-friction



本文更新与2021-01-29 09:56,由作者提供,不代表本网站立场,转载请注明出处:https://www.bjmy2z.cn/gaokao/584866.html

标记活细胞内蛋白质的化学标签的相关文章