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berth已完成基因组测序的生物(植物部分)

作者:高考题库网
来源:https://www.bjmy2z.cn/gaokao
2021-01-28 10:46
tags:

berth-苛捐杂税

2021年1月28日发(作者:dino)


水稻、玉米、大豆、甘蓝、白菜、高粱、


黄瓜


、 西瓜、马铃薯、


番茄


、拟南芥、


杨树、 麻风树、苹果、桃、葡萄、


花生




拟南芥



籼稻



粳稻



葡萄



番木瓜



高粱



黄瓜



玉米



栽培大豆



苹果



蓖麻



野草莓


马铃薯



白菜



野生番茄




番茄





甜瓜



香蕉



亚麻



大麦



普通小麦



西瓜



甜橙



陆地棉





毛竹





芝麻



杨树



麻风树




卷柏



狗尾草属



花生




甘蓝






物种



基因组大小和开放阅读框



文献



Sesamum indicum L. Sesame


芝麻



2n = 26




293.7 Mb, 10,656 orfs 1


Oryza brachyantha


短药野生稻



261 Mb, 32,038 orfs 2


Chondrus crispus Red seaweed


爱尔兰海藻



105 Mb, 9,606 orfs 3


Pyropia yezoensis susabi-nori


海苔



43 Mb, 10,327 orfs 4


Prunus persica Peach




226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5


Aegilops tauschii


山羊草(


DD




4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6


Triticum urartu


乌拉尔图小麦(


AA




4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7


moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)


毛竹



2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8


Cicer arietinum Chickpea


鹰嘴豆



~738-Mb



28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740 Mb),


27,571 orfs 10


Prunus mume




280 Mb, 31,390 orfs 11


Gossypium hirsutum L


.


陆地棉



2.425 Gb 12


Gossypium hirsutum L.


雷蒙德氏棉



761.8


?


Mb 13


Citrus sinensis



甜橙



87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14


甜橙



367 Mb 15


Citrullus lanatus watermelon


西瓜



353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16


Betula nana dwarf birch


,矮桦



450 Mb 17


Nannochloropsis oceanica CCMP1779


微绿球藻


(产油藻类之一)



28.7 Mb



11,973


orfs 18


Triticum aestivum bread wheat


普通小麦



17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19


Hordeum vulgare L. barley


大麦



1.13 Gb of 5.1 Gb



26,159 high confidence orfs



53,000 low confidence orfs 20


Gossypium raimondii cotton


雷蒙德氏棉



D subgenome,88% of 880 Mb 40,976 orfs


21


Linum usitatissimum flax


亚麻



302 mb (81%), 43,384 orfs 22


Musa acuminata banana


香蕉



472.2 of 523


?


Mb, 36,542 orfs 23


Cucumis melo L. melon


甜瓜



375 Mb

< br>(


83.3%



27,427 orfs 24


Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli



(砀山酥梨)



512.0 Mb (97.1%),


42,812 orfs 25,26


Solanum lycopersicum


番茄



760/900 Mb



34727 orfs 27


S. pimpinellifolium LA1589


野生番茄



739 Mb


Setaria


狗尾草属(谷子、青狗尾草)



400 Mb



25000-29000 orfs 28,29


Cajanus cajan pigeonpea


木豆



833 Mb



48,680 orfs 30


Nannochloropis gaditana


一种海藻



~29 Mb, 9,052 orfs 31


Medicago truncatula


蒺藜苜蓿



350.2 Mb, 62,388 orfs 32


Brassica rapa


白菜



485 Mb 33


Solanum tuberosum


马铃薯



0.73 Mb


,39031 orfs 34


Thellungiella parvula


条叶蓝芥



13.08 Mb 29,338 orfs 35


Arabidopsis lyrata lyrata


玉山筷子芥


? 183.7 Mb, 32670 orfs 36


Fragaria vesca


野草莓



240 Mb



34,809 orfs 37


Theobroma cacao


可可



76% of 430 Mb, 28,798 orfs 38


Aureococcus anophagefferens


褐潮藻



32 Mb, 11501 orfs 39


Selaginella moellendorfii


江南卷柏



208.5 Mb, 34782 orfs 40


Jatropha curcas Palawan


麻疯树



285.9 Mb, 40929 orfs 41


Oryza glaberrima


光稃稻(非洲栽培稻)



206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs (>70%


coverage) 42


Phoenix dactylifera


棕枣



380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs 43


Chlorella sp. NC64A


小球藻属



40000 Kb, 9791 orfs 44


Ricinus communis


蓖麻



325 Mb, 31,237 orfs 45


Malus domestica (Malus x domestica)



苹果



742.3 Mb 46


Volvox carteri f. nagariensis 69-1b


一种团藻



120 Mb, 14437 orfs 47


Brachypodium distachyon


短柄草



272


?


Mb



25,532 orfs 48


Glycine max cultivar Williams 82


栽培大豆



1.1 Gb, 46430 orfs 49


Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana Tripsacum


dactyloides var. meridionale


无法下载附表



50


Zea mays mays cv. B73


玉米



2.06 Gb, 106046 orfs 51


Cucumis sativus 9930


黄瓜



243.5 Mb, 63312 orfs 52


Micromonas pusilla


金藻



21.7 Mb, 10248 orfs 53


Sorghum bicolor


高粱



697.6 Mb, 32886 orfs 54


Phaeodactylum tricornutum


三角褐指藻



24.6 Mb, 9479 orfs 55


Carica papaya L. papaya


番木瓜



271 Mb (75%), 28,629 orfs 56


Physcomitrella patens patens


小立碗藓



454 Mb, 35805 orfs 57


Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115


葡萄



504.6 Mb, 29585 orfs 58


Vitis vinifera PN40024


葡萄



475 Mb 59


Ostreococcus lucimarinus


绿色鞭毛藻



13.2 Mb, 7640 orfs 60


Chlamydomonas reinhardtii


莱茵衣藻



100 Mb, 15256 orfs 61


Populus trichocarpa


黑三角叶杨



550 Mb, 45000 orfs 62


Ostreococcus tauri


绿藻



12.6 Mb, 7892 orfs 63


Oryza sativa ssp. japonica


粳稻



360.8 Mb, 37544 orfs 64


Thalassiosira pseudonana


硅藻



25 Mb, 11242 orfs 65


Cyanidioschyzon merolae 10D


红藻



16.5 Mb, 5331 orfs 66


Oryza sativa ssp. japonica



粳稻



420 Mb, 50000 orfs 67


Oryza sativa L. ssp. Indica


籼稻



420 Mb, 59855 orfs 68


Guillardia theta -


蓝隐藻,



551 Kb, 553 orfs 69


Arabidopsis thaliana Columbia


拟南芥



119.7 Mb, 31392 orfs 70


参考文献




1 Zhang, H. et al. Genome sequencing of the important oilseed crop Sesamum


indicum L. Genome Biology 14, 401 (2013).


2 Chen, J. et al. Whole-genome sequencing of Oryza brachyantha reveals mechanisms


underlying Oryza genome evolution. Nat Commun 4, 1595 (2013).


3 Collé


n, J. et al. Genome structure and metabolic features in the red seaweed


Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida. Proceedings of the


National Academy of Sciences 110, 5247-5252 (2013).


4 Nakamura, Y. et al. The first symbiont-free genome sequence of marine red alga,


susabi-nori Pyropia yezoensis. PLoS ONE 8, e57122 (2013).


5 Verde, I. et al. The high-quality draft genome of peach (Prunus persica) identifies


unique patterns of genetic diversity, domestication and genome evolution. Nature


Genetics advance online publication (2013).


6 Jia, J. et al. Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for


wheat adaptation. Nature 496, 91-95 (2013).


7 Ling, H.-Q. et al. Draft genome of the wheat A-genome progenitor Triticum urartu.


Nature 496, 87-90 (2013).


8 Peng, Z. et al. The draft genome of the fast-growing non-timber forest species moso


bamboo (Phyllostachys heterocycla). Nature Genetics 45, 456-461 (2013).

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