toxicant生物信息网站

2021年1月19日发(作者：buttermilk)
文献：
Medline/Uncover/pubmed
：
/pubmed/ ?term=chymosin

中国知网：
/kns/brief/default_

核酸数据库：
EMBL/DDBJ/GENSCAN
：
/

PDB
结构预测：
/pdb/home/

NCBI
：
/guide/sequence-analysis/

序列对比
BLAST
：
/?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastHo me

蛋白质功能：
/


EMBL
：
/

EBI Search
：
/ebi search/?db=emblrelease_standard&t=myosin

Uniprot
：
/uniprot/Q9Y4I1#sequences

NCBI BLAST+
：
/Tools/sss/ncbiblast/


DDJB:
/

Search and Analysis
：
/

Blastn
：
/blast/blastn?lang=en


蛋白质二级结构预测

CFFSP
：
/

Predictprotein
：
/

SOPMA
：
/cgi-bin/npsa_?page=npsa_

garnier
：
/cgi-bin/?#forms::garnier

PSSFinder
：


DSSP
：

蛋白质三维结构预测
swissmodel
：

/interactive




























phyre2
：
/phyre2/html/?id=index

NDB / BioMagResBank / CCSD
启动子
&
基因上游调控区预测
Promoter Scan
：
/molbio/proscan/

/services/Promoter/

CpG
位点预测
BMB L
：
/Tools/seqstats/emboss_cpgplot/

Softberry:
/?topic=polyah&group=programs&s ubgroup=promoter

Mobyle
：
/cgi- bin/?#forms::cpgplot

转录终止信号
polyA
位点预测：

/?topic=polya h&group=programs&subgroup=promoter

蛋白质跨膜区预 测
TMHMM-2.0
：
/services/TMHMM-2.0/

跨膜方向
TMPRED
：
/software/TMPRED_

蛋白质理化性质分析：
/protparam/

CAI
（
Calculate codon adaptation index
）：
/cgi-bin/?#forms::cai

结构域预测
interpro
：
/interpro/



Pfarm / CDD
SCOP
：
/scop/

基因调控区预测
-
softberry 20
人
/
天：

/?topic=tssg&group= programs&subgroup=promo
ter

密码子优化软件
OPTIMIZER
：
Jcat
：
/

/OPTIMIZER/