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UTR
UTR
在
人
mRNA
中的结构示意图
UTR
(
Untranslated
Regions)
即非翻译区,是
mRNA
分子两端的非编码
片段。
5'-UTR
从
mRNA
起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至
AUG
起始密码子,
3'-UTR
从编码区末端的终
止密码子延伸至多聚
A
尾巴(
Poly
-A
)的末端。
扩展阅读:
TAIL-
PCR
(
thermal asymmetric
interlaced PCR
)
主要用于从已知序列扩增旁邻序列,是华南农业大学的刘耀光教授发明的技术,现在已经
广泛的应用于一些插入因子突变体库的侧翼序列分离中。
在分子生物学研究中
,
基因克隆和分子杂交的探针制备等操作常需分离与已知
RNA
序列邻
近的未知序列,
TAIL-PCR
又叫热不对称交错
PCR
,能够较好地解决上述难题
。该技术通过
3
个嵌套的特异性引物分别和简并引物组合进行连
续的
PCR
循环,利用不同的退火温度选
择性地扩增目标片段,所获得的片段可以直接用做探针标记和测序模板。
TAIL-PCR
技术简单易行,反应高效灵敏,产物的特异性
高,重复性好,能够在较短的时间
内获得目标片段,已经成为分子生物学研究中的一种实
用技术。经改良过的
TAIL-PCR
成
功地从突变体中克隆到外源插入基因的旁侧序列,从而为启动子的克隆提供了有效的新方
法。
在利用特异引物和随机引物进行
PCR
中一般有
3
种产物生成:<
/p>
①
由特异性引物和简并引物扩增出的产
物;
②
由同一特异性引物扩增出的产物;
③
由同一简并引物扩增出的产物。
在
TAIL-PCR
反应中,其中后<
/p>
2
种目标产物可以通过以嵌套的特异性引物进行的后续反应
来消除。
TAIL-PCR
的基本原理是利用
目标序列旁的已知序列设计
3
个嵌套的特异性引物
(
special primer
,简称
sp1
,
sp2
,
sp3
,约
20bp
),用它们分别和
1
个具有低
Tm
p>
值的短
的随机简并引物(
arbitrar
y degenerate prime
,
AD
,约
14bp
)相组合,以基因组
RMA
为
模板,根据引物的长短和特异性的差异设计不对称
的温度循环,通过分级反应来扩增特异
引物。
TAIL-PCR
共分
3
次反应。
第一次反应包括
5
次高特异性、<
/p>
1
次低特异、
10
次较低特异性反应和
12
个热不对称的超
级循环。
5
次高特异性反应,使
s
p1
与已知的序列退火并延伸,增加了目标序列的浓度;
1
p>
次低特异性的反应使简并引物结合到较多的目标序列上;
10
次较低特异性反应使
2
种引物
均与模板退火,随后进行
12
次超级循环。经上述反应
得到了不同浓度的
3
种类型产物:
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