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核糖开关

作者:高考题库网
来源:https://www.bjmy2z.cn/gaokao
2021-02-27 21:23
tags:

-

2021年2月27日发(作者:skymaster)


核糖开关的研究进展



摘要:核糖开关是


mRNA


上能够与自由代谢产物或其他小分子配体结

< br>合或由于环境条件变化而引起构象变化从而调控基因表达的


RNA



构原件。原核生物中发现了大量的核糖开关,在真菌、植物和高等动


物人的血管内皮生长因子基因中也有发现。


核糖开关主要有两种调控


机理:调控转录提前终止和调控翻译开始。此外,核糖开关还参与


m RNA


加工和可变剪辑等过程。



关键词:核糖开关、基因表达、调控



the Research Progress of Riboswitches


Summary



The mRNA riboswitches is able and free metabolites


or other small molecule ligand binging or due to changes in


environmental


conditions


by


conformational


changes


of


RNA


regulation


of


gene


expression


and


thus


the


original


strucure


.


We have found a large number of prokaryotic ruboswutches in


fungi,also in plants ,higher animals and the human vascular


endothelial


growth


factor



are


two


main


riboswitches


regulation


mechanism:early


termination


of


transcription


regulation and regulation of translation addition,


riboswitches also involved in mRNA processing and variable


process of editing,etc.



Keyword: riboswitches



gene expression



control


核糖开关是由耶鲁大学的分子生物学家


Ronald Bre aher


和他


的同事在受


Andrew


[1]


等人的研究成果启发下发现并命名的,

< br>它是能够


与代谢物或其他小分子配体结合,


通过构象变化 调控目的基因转录或


翻译的


RNA


结构 元件


[2-5]


。核糖开关多位于受调节基因的


5


/



3

/


非翻


译区或是高等动物基因的内含子区,极少数存在于基 因的翻译区


[6]


,



2002


年首次发现维生素


B


12


核糖开关以来,


人们先后在细菌、


真菌、


植物及高等动物代谢相关基因中也发现了核糖开关的存在。



1


、核糖开关的种类及结构组成



核糖开关的配体多是小分子化合物,其中包括很多酶类的辅酶


或 辅基,


以及这些酶的相应代谢产物。


根据配体的类型迄今发现的 核


糖开关有十多种,其中除了温度感应的


RNA


热敏元件和


glmS


核酶外


其 他均以与其结合的配体命名,如维生素


B


12

< br>核糖开关、腺嘌呤核糖


开关等


[7]

。根据核糖开关与配体结合部位二级结构的不同,


Montange


等将核糖开关分为两大类型:一种是以嘌呤核苷酸核糖开关为代表,


其主要特征 是配体结合部位是一个单环结构,


这种结构使配体诱导的


RNA


构象变化仅发生在一个窄的区域;另一种以焦磷酸硫胺素(


TT P



核糖开关为代表,主要特征是配体结合部位存在两个以上的 茎环结


构,配体结合后


RNA


可以在大 的区间发生构象变化


[8]


。对于目前已知

空间结构的核糖开关,其中嘌呤核糖开关,


glmS


核酶,


SAM-


Ⅱ核糖


开关,葡糖胺


-6-


磷酸核糖开关,


L-box


核糖开关等属于第一大类型,


TPP


核糖开关,


SMA-


Ⅰ核糖开关,


Mg


2+


核糖开关等属于第二大类型。


< br>核糖开关也称为


RNA


分子开关



RNA


switch


< p>
由适体域



aptamer

domain



AD


)和表达平台 (


expression platform



EP


)两部分组成


[9]


。< /p>




原核生物核糖 开关位于


mRNA



5UTR


,由适体域和表达平台两部分组成,并且存在一定的重叠区域



核糖开关的结构



适体域可折叠成多维 结构,


选择性的结合目标代谢物,


并感知代

谢物浓度的变化,


具有高度的亲和性及特异性。


表达平台位 于适体域


的下游,通常与适体域有一定程度的重叠。代谢物结合后,表达平台

< p>
RNA


折叠状况发生改变,调控基因表达。适体域由


70-170


个核苷酸


组成,保证了对配体识别的亲和力和特 异性。适体域柔韧性很强,可


以形成不同的二级结构。


适体域特 异的序列和结构特征是区分各种类


型的核糖开关的依据。


不同物 种的核糖开关的适体域的核苷酸序列非


常保守,


但是不同类型甚 至同一类型核糖开关的表达平台的序列、



构和调节机理却相差 甚大。



2


、核糖开关的作用机理


< p>
核糖开关结合代谢物配体后通常抑制下游基因表达


,


偶尔也有激


活目标基因表达的情况


(


如腺嘌呤核糖开关、甘氨酸核糖开关


)


。但

< br>并不是


RNA


本身结构上的缺陷引起核糖开关的这种偏向 性


,


而是因为


细菌总能频繁感知各种过 量的代谢物


,


需要抑制相关生物合成或转运

基因的表达


[9]



。核糖开关主 要有两种调节机理:调控转录提前终止


和调控翻译起始。


此外,


核糖开关还参与


mRNA


加工和可变剪 辑等过程。


调控转录终止和翻译起始利用相似


RNA

< p>
折叠变化都涉及


Watson-Crick


碱基配 对。


配体结合到核糖开关后


,


适体域结 构重排


,


形成一种典型的


稳定构象。而 没有配体结合时


,


适体域和表达平台又能形成另一种构


象。


核糖开关调控过程涉及很多生化过程的精确协调

,



RNA


折叠、



录延伸、代谢物结合、螺旋形成、核糖体结合以及


m RNA


加工等。



在转录水平上


,


配体的存在可以阻止抗终止子和终止子的结合


,


使终止子能够形成稳定的发夹结构


,


导致


RNA


聚合酶提前脱落


,


转录


形成无活性的短的


mRNA

< p>
转录物。在翻译水平上


,


配体的存在可以促


使抗


SD


序列


(an ti-Shine-Dalgarno sequence)



SD


序列结合


,


核糖

< br>体不能附着到


mRNA



,


引起翻译提前终止。


[10]


< p>
核糖开关与


sRNA


等其他非编码


RNA


一样


,


被认为来源于原 始的


RNA


世界


,

< br>是


RNA


世界遗留下来的分子化石

,


在基因调控中有着非常重要


的作用


.


核糖开关调节基因表达不需要任何蛋白因子作为中介


,< /p>


而是


直接将


mRNA


编码的基因信息同其周围化学环境之间建立起了联系


.

-


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-


-



本文更新与2021-02-27 21:23,由作者提供,不代表本网站立场,转载请注明出处:https://www.bjmy2z.cn/gaokao/676084.html

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