-
氨基酸密码子对照表
丙氨酸
精氨酸
Alanine
Arginine
A
或
Ala
89
、
079
CH 3 -
脂肪族类
HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3
碱性氨基酸
R
或
Arg
174
、
188
-
类
天冬酰胺
Asparagine
N
或
Asn
132
、
104
H 2 N-CO-CH 2 -
酰胺类
Aspartic
D
或
Asp
133
、
089
HOOC-CH 2 -
acid
半胱氨酸
Cysteine
C
或
Cys
121
、
145
HS-CH 2 -
谷氨酰胺
Glutamine
Q
或
Gln
146
、
131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
天冬氨酸
谷氨酸
甘氨酸
组氨酸
Glutamic
acid
Glycine
E
或
Glu
147
、
116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
G
或
Gly
酸性氨基酸
类
含硫类
酰胺类
Histidine
H
或
His
异亮氨酸
Isoleucine
I
或
Ile
亮氨酸
Leucine
L
或
Leu
赖氨酸
蛋氨酸
Lysine
K
或
Lys
Methionine
M
或
Met
Phenylalani
苯丙氨酸
F
或
Phe
165
、
177
Phenyl-CH 2 -
ne
脯氨酸
Proline
酸性氨基酸
类
75
、
052
H-
脂肪族类
N=CH-NH-CH=C-CH 2 -
碱性氨基酸
155
、
141
|__________|
类
131
、
160
CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )-
脂肪族类
131
、
160
(CH 3 ) 2 -CH-CH 2 -
脂肪族类
碱性氨基酸
146
、
17
H 2
N-(CH 2 ) 4 -
类
149
、
199
CH 3 -S-(CH 2 ) 2 -
含硫类
芳香族类
亚氨基酸
羟基类
羟基类
芳香族类
芳香族类
脂肪族类
-N-(CH 2 ) 3
-CH-
P
或
Pro
115
、
117
|_________|
丝氨酸
Serine
S
或
Ser
105
、
078
HO-CH 2 -
苏氨酸
Threonine
T
或
Thr
119
、
105
CH 3 -CH(OH)-
Phenyl-NH-
CH=C-CH 2 -
色氨酸
Tryptophan
W
或
Trp
204
、
213
|___________|
酪氨酸
Tyrosine
Y
或
Tyr
181
、
176
4-OH-Phenyl-CH 2 -
缬氨酸
Valine
V
或
Val
117
、
133
CH 3 -CH(CH 2 )-
与核苷酸序列相关的特征关键词表
氨基酸密码子对照表
关键词
allele
attenuato
r
C_region
CAAT_sign
al
CDS
说明
相关的个体或菌株含有相同基因
的稳定的其它形式
,
该形式区别于这一位置的
< br>现有的序列
(
与或许其它序列
)
存在调节转录的终止的
DNA
区域
,
它控制了一些细菌操纵子的表达
; (2
)
位于启
动子与第一个结构基因之间
,
引起转录的部分终止的序列区段
免疫
球蛋白轻与重链的恒定区
,
与
T-
细胞受体α
,
β
,
与γ链
;
根据特定的链可包
括一个或多个外显子
CAAT
< br>盒
;
位于可能参与
RNA
聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的
75bp
< br>上
游的保守序列的一部分
;
共有
序列＝
GG(C
或
T)CAATCT
编码序列
;
对应于蛋白质中的氨基酸序
列的核苷酸的序列
(
位置包括终止密码
子
);
特征包括氨基酸概念上的翻译
Conflict
在这一位点或区域
,
单独确定的“相同”序列有所不同
D-loop
置换环
;
线粒体
DNA
内的一个区
域
,
其中
RNA
的短的序列与
DNA
的一条链配对
,
代
替了这一区域的原始配对
DNA
链
;
也用于说明在
RecA
蛋白质催化的反应中
,
侵入<
/p>
的单链替代双链
DNA
的一条链的区域<
/p>
D-segment
免疫球蛋白重链
的多变区
,
与
T-
细胞受体的β链
Enhancer
顺
式
-
作用序列
,
它增强了
(
一些
)
真核生物启动子的作用
,
并能在任一方向与与
启动子相关的任何位
置处
(
上游或下游
)
起作用
Exon
编码剪接
mRNA
部分的基因组区域
;
可以含有
5'UTR,
所有
CDS,
与
3'UTR
GC_signal
GC
盒
;
位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含
GC
区域
,
可以以多重拷
贝或任一方向存在
;
共有序列
=GGGCGG
gene
鉴定为基因的生物学意义的区域
,
并已
经指定名称
iDNA
间插
DNA;
通过几种重组中的任何一种能被消除的
DNA
intron
被转录的<
/p>
DNA
区段
,
但
通过同时剪接位于其两侧的序列
(
外显子
)
即可从转录本内
部将其除去
J_segment <
/p>
免疫球蛋白轻链与重链的连接区段
,
与<
/p>
T-
细胞受体α
,
β与γ链
LTR
mat_pepti
de
misc_bind
ing
misc_diff
erence
长
的末端重复
,
在确定序列的两端直接重复的序列
,
类型典型地见于逆转录病
毒中
成熟的肽或蛋白质的编码序列
;
翻译后修饰之
后成熟的或最终的肽或蛋白质产
物的编码序列
;
位置不包括终止密码子
(
与相应的
CDS
不同
)
不能用任何其它<
/p>
Binding
关键词
(primer_
bind
或
protein_bind)
表述的与另一
个组成成分共价或非
-
共价结合的核酸中的位点
特征序列与记载中存在的有所不同<
/p>
,
并且不能用任何其它不同关键词
(co
nflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,alle
le
或
modified_base)
表述
不能用任何其它的特征关键词表
述的具有生物学意义的区域
;
新的或少见的特
< br>征
任何一般性的
,
位点特异性的或复制的重组事件的位点
,
该位点中
有不能用其它
重组关键词
(iDNA
与
virion)
或来源关键词的修饰词
(/transposon,/proviral)
表述的双螺旋
DNA
的断裂与愈合
misc_feat
ure
misc_reco
mb
氨基酸密码子对照表
misc_RNA
不能用其她
RNA
关键词
(prim_transcript,precurso
r_RNA,mRNA,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,C
DS,
sig_peptide,transit__
__peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,
rRNA,tRNA,scRNA
与
snRNA)
限定的任何转录本或
RNA
产物
misc_sign
含有控制或改变基因功能或表达
之信号的任何区域
,
所述信号不能用其她
al
Signal
关键词
(pro
moter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal
,GC_signal,RBS
,polyA_signal,enhancer,at
tenuator,terminator,
与
rep_ori
gin)
表述
misc_stru<
/p>
不能用其她
Structure
关键词<
/p>
(stem_loop
与
D-loop)
表述的任何二级或三级结
cture
构或构象
modified_
被指示的核苷酸就是经修饰的核苷酸
,
并应由
被指示的分子
(
在
mod_base<
/p>
修饰词
base
意义中给出
)
所取代
mRNA <
/p>
信使
RNA;
包括
5'
非翻译区
(5'UTR),
编码
序列
(CDS,
外显子
)
与３
'
非翻译区
(
３
'UTR)
mutation
在此位置处
,
相关品系的序列中具有突然的
,
可遗传的变化
N_region
在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸
Old_seque
nce
PolyA_sig
nal
PolyA_sit
e
Precursor
_RNA
在此位
置处
,
所表述的序列修改了此序列以前的版本
< br>
聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解
RNA
转录本所必需的识别区域
;
共有序列＝
AATAAA
RNA
转录本上的位点
,
通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基
仍不就是成熟的
RNA
产物的任何
RNA
种类
;
可包
括
5'
剪切区
(5'clip),5'
非翻译
区
(5'UTR),
编码序列
(CDS,
外显子
),
间插序列
(
内含子
),3'
非翻译区
(3'UTR),
与
3'
剪切区
(3'clip
)
prim_tran
初级
(
最初的
,
未加工的
)
转录本
;
包括５
'
剪切区
(
５
'clip),
５
'
非翻译区
(
５
script
'UTR),
编码序列
(CDS,
外显
子
),
间插序列
(
内含子
),3'
非翻译区
(3'U
TR)
与
3'
剪
切区
(3'clip)
prim_bind
起始复制
,
转录或逆转录的非－共价的引物结合位点
;
包括合成的例如
PCR
引物
元件的位点
Promoter
参与
RNA
聚合酶的结合以启动转录的
DNA
分子区域<
/p>
protein_b
核酸上非－共价的
蛋白质结合位点
ind
RBS
核糖体结合位点
repeat_re
gion
repeat_un
it
rep_origi
n
RRNA
含有重复单位的基因组区域
单个重复元件
复制起点
;
复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点
成熟的核糖体
RNA;
将氨基酸装配成蛋白质
的核糖核蛋白颗粒
(
核糖体
)
中的
RNA
成份
S_region
免疫球蛋白重链的开关区
< br>;
它参与重链
DNA
的重排
,
导致来自相同
B
－细胞的不
同免疫球蛋白类的表达
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