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dbGaP
数据库申请步骤说明
【
dbGaP
数据据简介】
基因型和表型数据库(
dbG
aP
,)是国立卫生研究院
(NIH)
赞助的用于归档、
精选和发布由调查基因型和表型间相互作用的研究所产生的信息的数据
仓库。
该数据库收录的资料
来自由
NIH
资助的全基因组关联分析(
genome-wide
association study, GWAS
)结果。
dbGap
是有
NCBI
开发并负责维护的数据库,
该数据库主要存放外显
子测序和
DNA
测序数据,以研究表型和基因型之间的对
应关系为主要目的。目前
dbGaP
数据库收
录的数据来自
25
个研究项目,用户可
以通过疾病名称或基因名称进行搜索、浏览。为了保证研究项目的机密性,
dbGaP<
/p>
数据库只接受“去识别(
de-identified
)”的数据,同时还要求使用个
人资料(
indi
vidual-level
)的研究者接受审核。不过,用户可以不受任何限
制的浏览研究文件、操作流程和项目问卷调查等资料。
申请数据无需缴纳费用,只需申请账号,然后申请欲下
载数据的下载权限,
下载相应数据,使用
SRA
toolkit
对下载数据进行解压,并生成对应格式文件。
dbGaP
数据库是一个关于基因型和表型的
individual-level
data
数据库。
dbGaP
数据库的申请有两种方式,一是申请
eRA commons
账号,二是
NIH
账号
(
仅供美国
NIH
内部人员使用
)
。
SAM
注册
()
、
注册
(/web/grants/.)
Duns
编码
()
< br>、
NCAGE
编码注册
()
、和官方验证()。
注意:在注册
eRA commons()
时
,
必须先将
SAM
注册成功后才可以进行注册
,
两
者都注册成功后进行
eRA
commons
注册。
p>
郑州大学
Duns
编码已注册成功,信息如
下(注:必须一字不差填写,因
为其中一步是核对填写信息和对方平台贮存信息是否一致
,如下图)
DUNS:
Legal Business Name: Zhengzhou
University
Address Line 1: NO.75, Daxue
North Rd., Er
’
qi District
(
英文半角
)
City:
Zhengzhou
States: Henan
Postal Code: 450052
NCAGE
编码注册步骤:
申请之前的
country
check
Type of entity--
(选择
Other
)
Emergency level--
(选择
< br>Emergency
)
Is
the entity to be registered as supranational organ
ization?--
(选择
No
)<
/p>
Country
—
China
Step 1 of
4
:
Initiator Data
(注意:
First name
p>
:
san
(如:张三)
Last name
:
zhang,
organization
name: Zhengzhou
University, Adress: NO.75, Daxue North Rd.,
Er
’
qi
District
必须和
DUNS
地址一致)
< br>
Step 2 of 4: (N)CAGE Data
(注意
:
Organization name: Zhengzhou University, Adress:
Daxue North
Rd
必须和
DUNS
地址一致)
Step 3
of 4: Request Data
Questionnaire - Type
of activity
Development of Public
Standards--No
Designer of Goods--No