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1
.
为什么需要新鲜的菌液?
首先,新鲜
的菌液易于培养,可以获得更多的
DNA
,同时最大限度地保证
菌种的纯度
.
2
.
如何提供菌液?
如果您提供新鲜菌液
,
用封口膜封口以免泄漏;
也可以将培养好的
< br>4
—
5ml
菌液沉淀下来,
p>
倒去上清以方便
邮寄。同时邮寄时最好用盒子以免邮寄过程中压破<
/p>
.
3
.
如何制作穿刺菌?
用灭菌过
1.5ml
或
2ml
离
心管加入
LB
琼脂
(7g/L)
斜面凝固,用接种针挑取分散良好的单菌落穿过琼脂直达
管底,不完全
盖紧管盖适当温度培养过夜,然后盖紧盖子加封口膜,室温或
4
度保存。
4
.
PCR
产物直接测序有什么要求?
<
/p>
1)
.扩增产物必须特异性扩增,条带单一
.
如果扩增产物中存在非特异性扩增产物,一般难以得到好的测序
结果;
.2
)必须进行胶回收纯化;
3
)
DNA
纯度在
< br>16
—
2.0
之间
.
浓度
50ng/ul
以上
.
5
.
<
/p>
为什么
PCR
产物直接测序必须进行
p>
Agarose
胶纯化?
如果不进行胶纯化而直接用试剂盒回收,经常会导致测序出现双峰甚至乱峰。这主要是非特异性扩增产物
或者原来的
PCR
引物去除不干净所导
致。
大多所谓的
PCR
纯化试剂盒
实际上只是回收产物而不能起到
纯化的作用的。对于非特异性扩增产物肯定无法去除,而且通常他们不能够完全去除所有的
PCR
引物,这
会造成残留的引物在测序反应
过程中参与反应而导致乱峰。
6
.
如何进
行
PCR
产物纯化?
PCR
产物首先必须用
Agarose
胶电泳,将特异扩增的条带切割下,然后纯化。使用凝胶回收试剂盒回收
.
p>
产
物用
ddH2O
溶解。
7
.
PCR
产物直接测序的好处?
A)
PCR
产物直接测序可以反映模板的真实情况
.
B)
省去克隆的实验费用和时间
.
C) PCR
产物测序正确的片段进行下一步克隆实验使结果更
有保障
.
D)
混合模板进行
PCR
的产物直接测序可以发现其中的点突变
.
8
.
对
用于测序的质粒
DNA
的要求有哪些?
对测序模板
DNA
的一般要求:
1).DNA
纯度要求高,
1.6
—
2.0
之间,不能有混合模板,也不能含有
p>
RNA
,
染色体
D
NA
,蛋白质等;
2).
溶于
ddH2O
中,溶液不能含杂质,如盐类,或
E
DTA
等螯合剂,将干扰测序
反应正常进行。
< br>
9
.
如何鉴定质粒
DNA
浓度和纯度?
我们使用水平琼脂糖凝胶电泳,并在胶中加入
0.5ug/ml
的
EB(
电泳缓冲液中不必加
EB)
,加一个已知浓度
的标准样品。电泳结束
以后在紫外灯下比较亮度,判断浓度和纯度。此方法可以更直接、准确地判断样品
中是否
含有染色体
DNA
、
RNA
等,也可以鉴别抽提的质粒
DNA
的不同构型。<
/p>
质粒
DNA
的
3
种构型是指在抽提质粒
DNA
过程中,由于各种原因的影响,使得超螺旋的共价闭合环状结
构的质粒
(SC)
的一条链断裂,变成开环状
(
OC)
分子,如果两条链发生断裂,就变成为线状
(L)
分子。这
3
种
分子有
不同的迁移率,通常,超螺旋型
(SC)
迁移速度最快,其次为
线状
(L)
分子,最慢为开环状
(OC
)
分子。
使用紫外分光光度计检测,或者用溴乙锭
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标准浓度
DNA
比较法只
能检测抽提到的产物中的浓度,甚至由
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