-
欢迎
欢迎使用
Materials Studio
Materials
Studio
是
一个采用服务器
/
客户机模式的软件环境，它为你的
PC
机带
来世界最先进的材料模拟和建模技术。<
/p>
Materials
Studio<
/p>
使你能够容易地创建并研究分子模型或材料结构，使用极好的
制图
能力来显示结果。与其它标准
PC
软件整合的工具使得容易共享
这些数据。
Materials Studio
的服务器
/
客户机结构使得你的
Windows NT/2000/XP
，
Linux
和
UNIX
服务器可以运行复杂的计算，并
把结果直接返回你的桌面。
Materials
Studio
采用材料模拟中领先的十分有效并广泛应用的模拟方法。
Accelry
’
s
的多范围的软件结合成一个集量子力学、
分子力学、
介观模型
、
分析工具模
拟和统计相关为一体容易使用的建模环境。
卓越的建立结构和可视化能力和分析、
显
示科
学数据的工具支持了这些技术。
无论是使用高级的运算方法，
还是简单地利用
Materials
Studio
增强你的报告或
演讲，你都可以感到自己是在用的一个优秀的世界级材料科
学与化学计算软件系统。
易用性与灵活性
Materials
Studio
可以在
Windows 98,Me
，
NT
，
2000
和
XP
下运行。用户界面符
合微软标准，
你可以交互控制三维图形模型、
通过简单的对
话框建立运算任务并分析
结果，这一切对
Windows
用户都很熟悉。
Materials
Studio
的中心模块是
Materials Visual
izer
。它可以容易地建立和处理图
形模型，
包括有机无机晶体、
高聚物、
非晶态材料、
表面和层状结构。
Materials Visualizer
也管理、显示并分析文本、图形和表格格式的数据，支持与其它字处理、电子表格和
演示软件的数据交换。
Materials
Studio
是一个模块化的环境。每种模块提供不同的结构确定、性
质预
测或模拟方法。你可以选择符合你要求的模块与
Mater
ials
Visualizer
组成一个无缝的
环境。你也可以把
Materials
Visua
lizer
作为一个单独的建模和分子图形的软件包来运
行。<
/p>
如果你安装了
Materials <
/p>
Studio
的其它模块，后台运算既可以运行在本机，也可
以通过网络运行在远程主机上。这取决于你建立运算时的选择和运算要求。
< br>Materials
Studio
的客户机
/
服务器模式支持服务器端运行在
Windows
NT/2000/XP
，
Linux<
/p>
或
UNIX
下，使得你可以最大化利用计
算资源。
效率和交流
所以的研究人员都可以从
Materials Studio<
/p>
强大功能中获益。
这份文档的
“演示”<
/p>
部分给出了一些简单的分子和材料的模型。
这能使你获得对材料的
更好的理解并能创
建优秀的图形。与其它
Windows
软件的协同工作使得能容易地拷贝粘贴这些图形到
其它文档。结构和性
质的数据能容易地从电子表格和数据库中导入导出。
Materials
Studio
帮助你显示和共享数据。
Materi
als Visualizer
也可以安装在研究部门、
生产部
门、
工程部门和营销部门来在不同部门中共享工作。
设计更好的材料
Materials
Visualizer
极大地提高了计算材料学的易用性。它在一个灵活易用的软
件环境中为化学家、
材料科学家和工程师带来了有力的方法。
它使交流有关材料结构
与性质和求解化学与材料工业中临界问题的观点变
得简单直观。
最近更新
Materials
Studio2.2
版更新
许多的重要新特征出现在
Materials
Studio2.2
版中，尤其发布了增强的量子力学工具，
< br>新的介观模型模块，全新的经典模拟能量计算引擎，还有很多内部结构和核心
Ma
terials
Visualizer
功能的升级。
新的产品
MesoDyn
。
MesoDyn
是预测装软凝聚态物质介观结构
动态组装，现在是
Materials
Studio
的
一个模块。
Materials Studio
版本中的
< br>MesoDyn
是对在
Cerius
2
版本功能上的一个大的升级。
MesoDyn
现
在能被用来解决形成动力学、自组装动力学和相界偏析等主要的工业问题
，这些对高聚物、
化学、电子、药物缓释、制药、生物技术和其它工业有重大意义。
MesoDyn
的使用者第一次能在介观
尺度上明确包括静电作用建模。新的积分选项提供了对
模板积分计算的显著改进。使用对
称多处理器进行并行模拟也会提高性能。复杂的
volume
visualization
选项允许用户创建
MesoDyn
预测的介观结构的极好的静态和动画图象。
< br>Forcite
。
Forcite
是
Materials
Studio
中新的原子模拟工具，它可用于能量计算和分子与周期
系统的几何优化。
Forcite
采用全新的算法，
可以调用
Dreiding
、
UFF
（通用力场）
和
COMPASS
等
力场。
Forcite
优化周期系统时可以考虑对称性，这对检
晶仪很有利。使用
UFF
力场可以
研究
金属茂合物等无机系统。
Forcite
仅在客户端使用。
Reflex
。
X-Cell
，一个新的粉末法索引工具，已被加入
Refle
x
功能中，这是分子结晶学会发
展的一个里程碑，
代表了索引技术的一次飞跃发展。
X-Cell
可以
揭示粉末衍射图案蕴含的结
构秘密，这已被证实用其它方法很难索引。
< br>X-Cell
在
2003
年
7
月发行。
Re
flex
的另一个革新是能和模拟的和试验的衍射图案一起独立显示出由
Pawley
or
Rietveld
refinement
造成的背景贡献。
Materials
Studio
模块的提高
Dmol<
/p>
3
。此版本的
Dmol
< br>3
在
Windows
和
Linux IA32
系统中性能有
3-4
％提高。
在所有平
台上并行性能都有所提高
。这使
Dmol
3
成为世界上最快的从
头计算代码之一。新增的
Handy-Tozer
功能使科学家
能模拟氢键结合系统，获得准确的分子结构和热力学数据，这使
得
Dmol
3
成为制药业的一个很重要的工具。
V
AMP
。
作为
Accelrys
从头计算和分子动力学连接工具
，
V
AMP
现在包含两个半经验方
法——
MNDO/d
和
AM1*
。
AM1*
设计用来处理
过渡金属元素。
V
AMP
在预筛选、<
/p>
fast geometry
过渡态搜索计算方面是一个优秀的工
具，
可用于均相催化等许多科研领域。
附加的过渡态搜
索功能使确定合适的过渡态搜索初始结构变得容易。
< br>CASTEP
。
使用最近建立的线性响应理论，
CASTEP
现在有能力计算声子频率。
声子频
率可用来显示声子散射曲线和声子密度状态，
就像电子能带结构
和状态点密度。
另外，
热力
学量，如自
由能和
Debye
温度也可以计算出来。这对
< br>CASTEP
技术是一个很大的进步，开
创了精确计算固
体系统热力学性质的道路。通过计算
Mulliken
cha
rges
，
CASTEP
用户可以
作
population
analysis
，包括每个角动量分量的
partial
charges
和
Mulliken bond
populations
。
PDP<
/p>
。
PDP
现在支持运行
< br>Tru64 UNIX
系统的
Compaq
Alpha
服务器。
Materials
Visualizer
的改进
队列系统
。
Materials
Studio
的所以模块都通过第三方队列软家支持串行工作提交。
2.2
版本支持一下队列：
·
Generic
NQS
（
Nwtwork Queuing System
）
，
3.50.9
版
.
·
Ope
nPbs
（
Portable Batch System
）
，
2.3.16
版
.
·
LSF
（
Load Sharing
Facility
）
，
.
注意：此版本的
Materials Studio
只在
SGI
计算机上运行
IRIX
操作系统时才支持
NQS
。<
/p>
除串行工作提交，
Dmol
3
、
CASTEP
和
Mes
oDyn
支持运行
PBS
Linux
架构的
MPI
并行工作
和运行
PBS
或
LSF
的对称多处理器。但是，
Windows
下<
/p>
LSF
不支持
MPI
并行处理。
我们计划支持其它的队列系统，以便定制其它方法的插件。
电荷工具
。
Materials
Visualizer
包含新的电荷工具，
Gasteiger
和
Qeq
。这些工
具可以根
据结合性和负电性给原子系统赋分数电荷。
现在
Forcite
支持的
UFF
和
Dreiding
两个力场与
电荷赋值方法无关。
密堆积
Materials
Visualizer
包含新的测量和监视密堆积结果的工具。
客户端自动存盘
。客户端
Materi
als
Studio
添加了自动存盘功能。这可以减小客户端
硬
件错误造成的影响。
Polymer
builder
。
Polymer
builder
已经提高了易用性。
网关
。本版本
Materials
Studio
可以通过代理连到网关。
平台改变
Materials
Studio
支持的平台有一下变化：
·
CASTEP
和
Dmol3
现在支持
Intel Itanium
64
位处理器。
·
所以
Materials
Studio
模块都支持
Red Hat Linux
平台。
除了
Dmol3
、
CASTEP
和
Mesodyn
外，其它都要求安装
PBS
。
支持新的平台
·最新的
SGI IRIX
－
6.5.15
和
6.5.16
·最新版
Red Hat
Linux
－
7.3
·
Red Hat Linux Advanced
Server
·
Red Hat Linux 7.2
for Intel Itanium
不再支持的平台
·
Windows NT Workstation 4.0
SP4 and SP5
·
Windows NT
Server 4.0 SP4 and SP5
·
Windows NT Server,
Enterprise Edition 4.0 SP4 and SP5
·
SGI IRIX 6.5.4 to 6.5.9
·
Red Hat Linux 6.2 and 7.0,
and 7.1
系统库文件变化
对
于
IRIX
系统，从以前版本
Mate
rials Studio
升级时需要
SCSL
Scientific Library
3.5
。
Materials Studio
< br>安装光盘包含这个完整的库文件，但必须单独安装。
硬件要求变化
客户端最低
CPU
要求为
Intel Pentium
II
或兼容处理器。
许可改变
在
Windows
和
UNIX
下。
最新版的
Accelrys License Pack
——
5.2
版，
都会作为<
/p>
Materials
Studio
安装
过程的一部分自动安装。安装过程中检测到的先前版本的
License
Pack
会自动升
级到最新版。
从
Materials Studio
2.1
开始，
Accelrys License
Pack
用来管理
Materials Studio
的许可。
由于这种提高，在
UNIX
和
Windows
平台下，你可以和
Accerlys
其它使用
License
Pack
的
产品共享许可，这些产品包括
Discover Studio
、
Cer
ius
2
、
Insight
Ⅱ
Materials
Studio
简介
Materials
Studio
特点
Materials
Studio
有一系列适合材料建模特点。
Materials
Visualizer
为
Materials Studio<
/p>
提
供了核心的建模能力和软件基础。
Materials
Visualizer
包括以下特点：
·模型三维可视化，有很多显示样式、参数和测量工具。
·草画和编辑分子模型，包括金属有机化合物。
·构造晶体。
·构造高聚物。
·构造表面、层、真空板状结构。
·分子和周期系统的对称性寻找及编辑工具。
·图形、图表和电子表格形式显示数据。
·使用
Materials
Studio
工程进行数据处理。
·高质量打印输出。
·管理监视服务器计算工作的工具。
另外还有集成到
Materials
Studio
中的独立产品，它们建成了一个范围广泛的材料建模
工具。
·
Amorphous C
ell
－非晶态材料的建模和性质预测，尤其适于高聚物、有机液体和它们
的混合物。
·
CASTE
P
－适用于固体材料的基于量子力学的第一原理平面波赝势软件。
客户机
/
服务器结构
注意
。
如果你要安装除<
/p>
Materials
Visualizer
以外的
Materials
Studio
产品，
必须阅读这段。
什么是客户机
/
服务器
客户机组件，如
Materials
Visualizer
，请求服务器组件，如
Dis
cover
，作一些计算。当
计算完成或达到一定的进度，
结果从服务器传到客户机。
客户机和服务器并不一定在同一台
电脑上运行。
Materials Stu
dio
客户机
/
服务器结构怎样工作的
？
Materials
Studio
使用了称之为
Disconnected Ser
ver
结构（
DSA
）
，
DSA
使用
HTTP
协议
在客户机
/
服务
器间传递信息，就是运作
Web
的技术。
客户机
/
服务器间的信息传递由称
为网关的软件处理，它安装在服务器端。网关接受客
户机的工作提交并传给安装在服务器
上的代码，
然后计算就开始了。
网关也向客户机报告计
算进度和结构。
你可以在任何电脑上建立网关
，无论是
UNIX
，
Windows<
/p>
还是
Linux
，在任何你喜欢的
服务器上进行计算，如果
Materials
Studio
服务器相关组件安装在那台电脑上。从客户机上
很容易安装网关。
如果有一台
PC<
/p>
运行
Windows
NT
，
2000
或者
XP
操作系统，你就可以在同一台电脑上
运行客户程序和服务程序。
下表列出了客户机和服务器在不同操作系统下的要求：
Clients
Servers
Windows 98
Windows NT
Workstation 4.0 - SP6a
Windows
Millennium (Me)
Windows NT Server 4.0 -
SP6a
Windows NT Workstation 4.0 - SP6a
Windows 2000 Professional, Server,
Advanced Server
Windows
2000
Professional
-
Retail,
SP1
-
Retail, SP1 and SP2
and SP2
Windows XP Home Edition
Windows XP Home Edition
Windows XP Professional
Windows XP Professional
Compaq
ES/GS
AlphaServers
running
Tru64
4.0F,
4.0G
, 5.1 or 5.1A
SGI IRIX - 6.5.10 -6.5.16
Red Hat Linux - 7.2 and 7.3 (Intel
compatible)
注意
：
Materials
Studio 2.2
不再支持
Red Hat Linux
6.2
和
7.1
，
< br>只支持
Red Hat Linux 7.2
和
7.3
。
通过
Materials
Studi
o
客户机
/
服务器结构，你可以从
PC
客户端向专用的
Windows
NT/2000/XP
、
UNIX
或
Linux
服务器提交计算。工作可以在不连
接模式下计算，这样他们与
你
PC
上的
资源无关。你可以在
PC
上注销，工作照样在服务器上运行。当
你重新在
PC
上
登录时，你可以看到计
算进度或结果。这些计算也可以在运行
Windows NT/2000/XP
的计算
机上本机运行。
客户机可以在任务运行时和它传递信息。
例如在分子动力学模拟过程中，
模型和图形可
以动态更新，
Discover
发送回来的信息可以显示在文本文件中。
你可以按自己需要选择这些<
/p>
的结合。任务和服务器状态状态都可以浏览。
Materials
Studio
在哪里计算？
Materials Studio
不同模块计算需要的资源不
同。计算可以分为两大类来考虑：
A
类——这些计算只需要很短的时间和很少的计算资源，它们并不经过网关或客户机
/
服务器结构。这类模块一直安装在客户端电脑里。
B
类——这类计算需要很长的时间和很多的计算资源，自然它们运行在专用的服
务器
上。它们以任务来运行，使用网关，由客户机
/
服务器结构控制。这类模块安装在运行
UNIX/Linux
或
Windows
NT/2000/XP
的服务器上。
下表总结了此版
Materials
Studio
每个模块所属计算种类和操作系统要求。
Windows
Windows
Windows
Windows
Windows
Tru64
Red
Hat
Module
Category
IRIX
98
Me
NT
2000
XP
UNIX
Linux
Materials
Visualizer
Amorphous
Cell
CASTEP
COMPASS
Discover
DMol
3
DPD
Equilibria
Forcite
MesoDyn
Reflex
Reflex
Plus
V
AMP
1
N/A
B
B
B
B
B
B
B
A
B
B
A
1
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
支持
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
A
1
,
2
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
?/center>
V
AMP
和
Reflex
的<
/p>
Power Indexing
组件只能以
B
类计算通过网关进行。
2
X-Cell
只能以
B
类计算通过网关进行。
Materials Visualizer
Materials
Visualizer
是
Materials Studio<
/p>
的核心模块，提供建模、分析和可视化的工具。
清晰直观的用户界
面提供了高质量的
Windows
标准环境，你可以添加任何其
它的
Materials
Studio
模块。
Materials Visualizer
提供了快速直观的
工具，使你能构造分子、晶体材料、表面、界面、
层结构和高聚物的图形模型。你能操纵
、查看并分析这些模型。
Materials
Visuali
zer
也处理
图表、表格和文本数据，提供软件基础和分析工具
，以支持所以的
Materials
Studio
产品。
Materials Visualizer
也可以单独运行，
来建立、显示和编辑结构。和其它
Windows
软件
交换数据是你轻易共享和报告结构和数据。
获得
Materials
Visualizer
帮助
Materials
Visualizer
< br>的帮助是
Materials
Studio
在线帮助的核心部分，在所有
Materials
Studio
安装中都有。
Amorphous Cell
Amorphous Cel
l
是建立复杂无定型系统代表性模型并预测主要性质的一套计算工具。
< br>你
能预测并研究的性质包括内聚能密度、
状态方程行为、
链堆砌和局部链运动。
Amorphous Cell
创建结构采用的方法是基于很好建立的产生包含链分子的疏松无序系统包含真实平衡构象。
其它的特点有建立包含小分子和高聚物任意比例混合的系统、
产生有序
向列相中间相和无定
型材料厚板的专门功能，这适合于创建界面模型，用于研究粘着和润
滑。
获得
Amorphous
Cell
帮助
Amorphous
Cell
是一个模块，你可以购买安装进
Materials
Studio
。如果你已经安装了
Amorphous
Cell
，
Materials Studio
在线帮助的目录栏会出现有关
Amorphous
的帮
助。
CASTEP
CASTEP<
/p>
最先由英国剑桥大学凝聚态理论小组开发，
它采用密度泛函理论模
拟很大一类
材料固体、
界面和表面的性质。
CASTEP
基于总能量的平面波赝势理论，
运用原子数目
和种
类来预测包括晶格参数、
分子对称性、
结构性质、
能带结构、
固态密度、
电荷密度和波函数、
光学性质。高效并行版本可以模拟包含数百原子的大系统。
获得
CASTEP
帮
助
CASTEP
是一个模块，你可以
购买安装到
Materials
Studio
中。如果你已经安装了
CASTEP
，
Materials Studio
的在线帮助目录中包括
CASTEP
的部分。
Dmol3
Dmol3
是独特的密度
泛函理论量子力学软件，可以研究气相、溶液、表面和固体系统。
由于它独特的静电学近
似，
Dmol3
一直是最快的分子密度泛函计算方法之一，
使用非局域化
的分子内坐标，
可以快速优化
分子和固体系统的结构。
使用
LST/QST
< br>算法和共扼梯度结合，
Dmol3
可以有效地搜索过渡态
，
避免了耗时的黑塞矩阵的计算。
过渡态搜索功能可以应用于<
/p>
分子和周期系统。
获得
Dmol3
帮助
Dmol3
是和
Materials
Studio
集成在一起的。
一旦你安装了
Dmol3
，
Materials Studio
在线
帮助目录栏就包含
Dmol3
帮助的部分。
PDP
耗
散系统粒子动力学（
PDP
）是动态模拟包含完备流体动力学相
互作用的流体粒子。潜
在的粒状粗糙性使得模拟跨越了传统分子模拟所达不到的长度和时
间（在相同硬件上）
。
Materials
< br>Studio
中的
PDP
的实现
包括了由原子模拟继承来的输入参数的详细指令。从更详
细的输入模拟中引出输入数据意
味着系统潜在的化学性质没有丢掉，
而是明确地包含在
PDP<
/p>
运行中。
PDP
采用周期性边界条件来有
效模拟无限系统。封闭效应可以通过使用二维板观
察出。
Lee
s
－
Edwards
边界条件可以用来
模拟剪切系统。表面张力和临界胶束凝聚（
critical
micellar concentration
）的性质也能
获得，还有大量的可视化和数字输出。
获得
< br>PDP
帮助
PDP
是一个模块，你可以购买并安装到
Materials
< br>Studio
环境中，如果你安装了
PDP
，
Materials Studio
的在线帮助目
录栏中会包含
PDP
帮助部分。
Discover
Discover
提供了功能强大的原子模拟方法，适用于很大范围的分子和材料。
Discover
是
Materials
Studio
的“模拟引擎”
。它集成了很大范围已被证明适用于分子设计的分子
力学和
动力学方法。
它使用精心设计的经验力场作为基础，
可以有把握的计算最小能量构象、
分子
系统
一系列构象和动态轨道。
Discover
为
< br>Amorphous Cell
等模块提供了计算基础。
周期性边
界条件可以用来模拟固态材料，
无论是晶态还是无定型
态或者是溶液。
包罗万象的分析特点
使得能够提取模拟的相关结
构。
获得
Discover
的帮助
Euilibria
Euilibria
是用于确定有机分子和高聚物相图的强大模块。
Equilibria
使用基于吉布斯系综
的蒙特
卡诺模拟发为基础。
这套工具可以计算纯组元在给定温度下汽
－液共存点、
二元和三元系在任意给定温度和
压强下汽－液或液
－液共存点。
临界常数工具可以根据补充的一系列纯组元的共存点预测临
界点。
使用这个强大的工具，
依据
Ising scaling law
，
从相图上已知的几
个共存点就可以获得
纯组元系统完整的相图。它也有计算任意给定温度下小分子的第二维
里系数的功能。
由于
Euilibr
ia
完全集成在
Materials
Studio
建模环境中，用户可以采用一下合理的模拟
过程：
首先画出组成分子自身，
建立无定型原胞，
接着进行蒙特卡诺模拟，
最后计算完整相
图。
获得
Equilibria
帮助
Forcite
Forci
te
是分子力学模块，可以使用经典力学对任意分子和周期系统进行势能和几何优
化计算。
Forcite
支持
COMPASS
、
UFF
和<
/p>
Dreiding
力场。藉由力场的广泛性，
Forcite
原则
上能处理任何材料。几何优化算法提供
了最速下降发、共扼梯度发、准牛顿发和完全牛顿
Rhapson
发，还提供了连续使用这些方法的灵巧方法。这使得可以准确地进行能量最小化计
算。
获得
Dorcite
帮助
MesoDyn
Me
soDyn
一直是研究大系统介观尺度的动态方法。这种算法动态地跟踪由化学势梯度<
/p>
和
Langevin
噪音造成地组元密度
场变化。系统不同组元间通过计算的能量或者
Flory
－
Huggins
参数的有效势来相互作用。它是牺牲原子水平上的细
节换取大系统和长时间的。
MesoDyn
< br>可以容易地研究微相分凝（
microphase
se
paration
）
、胶束偏聚（
mi
cellar
aggregation
）和自组装等现象。确
定几何行状地剪切和限制效应也可以研究。
MessDyn<
/p>
的应用包括：油漆和乳液、化妆品和其它个人用品、金属高聚物混合材料、
表面活性剂的溶解、复杂药物缓释物质和很多其它方面。
获得
MesoDyn
帮助
Reflex
Reflex
提供快速
交互的粉末衍射数据模拟。使用
Power Diffraction
< br>工具，模拟结构以图
形显示，
便于理解。
模拟结构可以直接和试验数据比较。
模拟结果可以在结构改变后立即更
新，以便和试验结构实时比较。可以进行
X
射线
、中子和电子衍射模拟。
Power Index
工具可以自动或手动寻峰，使用
TREOR90
、
DICVOL91
、
ITO15
或最新的
X
－
Cel
l
程序索引并自动确定空间群。
X
－<
/p>
Cell
是一个单独授权的工具，可以安装在
Reflex
模块中。
Power
Refinement
工具运行你修改
Pawley
refinement
和
Reitveld Refineme
nt
来最优化粉
末衍射模拟参数和晶体结构以便使模拟结果和试
验结果尽可能一致。
改变诸如衍射性质、
辐射种类、
配置函数和试样参数等变量是直接通过
Mate
rials Studio
对话框进行的。
< br>获得
Reflex
帮助
Reflex Plus
Reflex
Plus
是
Reflex
的高级版
本，在标准
Reflex
功能上加入了有效的粉末衍射结构分<
/p>
析技术。它提供了从高质量粉末衍射数据中确定晶体结构的完整功能。
Power
Solver
的方法：
·
Reflex Power Indexing
工具根据试验的粉末衍射图案索引确定晶胞参数和所属晶类。
·在
Reflex Power Refinement
模块中的改进的
Pawley
程序精修晶胞参
数、峰行状和背
景参数，它也是减小可能所属空间群的有用工具。
·
Power
Solve
方法搜索晶胞中可能的原子分子排列。它找到模拟结构尽可能与试验结
构接近的结构。
·最后的结果精修由
Reflex
中的
rigid
－
body Rietveld
Refinement
功能完成。
获得
Reflex
Plus
帮助
VAMP
V
AMP
是一个艺术级的半经验量子力学程序，用
于模拟气相和溶液中的反应和性质。
此程序已被优化的高度数
值稳定和快速，即使对大分子系统的计算也十分有效。
V
AMP
在几何和过渡态优化和静电学方面有很大改进。
它可以模拟溶解作用，
计算偶极
矩、极化率、电荷密
度、静电势、热力学性质和
13
C
化学
位移等性质。
获得
V
AMP
帮助
V
AMP
完全集成在
Materials Studi
o
环境中。你一旦安装了
V
AMP
，
Materais Studio
在线<
/p>
帮助目录栏会有
V
AMP
帮助部分。
COMPASS
COMPASS
是
支
持
凝
聚
态
材
< br>料
原
子
级
模
拟
的
功
能
强
大
的
力
场
。
COMPASS
代
表
Condensed-phase Optimized
Molecular Potentials for Atomistic Simulation Stud
ies
（原子模拟研
究的凝聚态优化分子势场）
。
COMPASS
是第一个
参数化和被凝聚态性质验证了的从头计算力场，
并加入了多种孤立
系统模拟用的从头计算和经验的数据。
因此，
这种力场能精确
同时预测在很大温度和压强范
围内，很多种孤立系和凝聚态分子的结构、构象、振动和热
力学性质。
COMPASS
最近的
改进在参数化了
45
种无机氧化物材料和包含有机无机材料混合
系统
界面。
COMPASS
是一个独立的产品，你可以购买并安装进
Materials
Studio
。
进一步信息
你可以在
Accelrys
站点获得有关
COMPASS
的进一步信息。
COMPASS
Contents
（需要密码）
本地化
Materials Stu
dio
能识别并正确处理不同地区的数据格式约定。例如：
Ma
terials Studio
运
行在配置为英语地区的
PC
上能正确地把
1,000
解释为
“一千”
。
但是，
如果配置为德国地区，
Materials Studio
把
1,000
解释为“一点零零零”
。
一个例外是：由
Materials
Studio
用户界口和服务程序产生的大多数文本文件和超文本
文件总是以英语约定习惯显示在屏幕上，而不管当前地区。
这些显示是只读的，不会破坏原来数据。
注意
：
演示部分的数据是以美国英语格式显示。
如果你的系统配置为其它地区，
在输入
数据前请转
换为当时格式。
例如，如果系统配置为德国地区，演示部分要
输入
5,000(
五千
)
，你应该键入
5.000
。
印刷上的约定
Materials
Studio
帮助使用以下印刷上的约定。
·描述界面元素的字用斜体。例如：
选择
File | Printer setup
…
，然后单击
Landscape
·你键入的字用蓝色。例如：
键入<
/p>
180
，并按回车。
< br>到帮助系统之外的链接，如到互联网
URL
的链接，前有
一个图片。例如：
Accelrys Materials Studio
homepage
链接会在一个新的浏览器窗口中打开。
Accelrys
信息资源
提供有关
Accelrys
公司的全部新闻和信息。
/materials/
包含
Accerys
公司有关材料科学的全部
产品和商业活
动，包括产品细节、最新产品、应用领域的背景信息、客户学习和
Accelrys
公司的科学
合作细节。
/customer/
< br>为
Accelrys
产品用户提供广泛的信息，包括常见
问
题的回答、获得支持的细节、用户组织和会议的信息和只对合作伙伴开放需要密码的资
料。
提供
Accelrys
站点与
Materials Studio
有关的所有产品
和支持的快捷方式。
其它信息资源
Accelrys
的发起者
MatHu
b
，是网上计算材料科学的焦点。
MatHub
由两部分组成—
—引用页和一本杂志。
引用页包括了材料建模和材料信息的背景信息、
分子建模的历史、
计算技术采用的理论
的有关解释和建模在工业和教育上的应用的信息。也有
其它的链接、软件、科学引文。
杂志刊出观点、评注和计算材料科学有关的当前信息。
Materials
Studio
界面
Materials
Studio
Visualizer
是符合微软标准的应用程序。它包含很多和其它微软产品相
似的用户接口界面元素。其余的符合微软标准，但为
Material
s Studio
所特有。
下面显示了
Materials
Studio
界面。
?
Menus
提供有关
Visualizer
的命令
?
Modules Menu<
/p>
提供了调用模块的功能。
模块可以单独购买，
能增加
Materials
Studio
的功能。
?
Toolbars
提供调用模块和其它常用命令的快捷方式。
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
?
Properties
Explorer
是查看和编辑对象属性的接口。
Project
Explore
用来查看和处理属于
Materials
Studio
工程的文档。
Job
Explore
可以便利地查看工程任务，你可以查看并处理它们。
Visualizer
底部的状态条显示有用提示和耗时
操作的进度。
Documents
包
含用来建模的数据。
3D Visualizer
提供三维模型文档的三维视图。
这对显示和处理原子和介观尺度结构
是很重要的。
Chart Viewers
提供图形文档的视图，一般用来显示二维
x-y
坐标轴的数据。
Grid Viewers
显示表格文档视图，它是标准的电子表格的接口。
Text
Viewer
显示简单文本文件和复杂的超文本文件。
对话框包含显示详细的选项的控件。
鼠标广泛的用来交互控制文档。
超文本帮助为你使用
Materials
Studio
提供详细的帮助
信息对话框警告错误发生或要求详细信息。
文档
Materials Stud
io
使用文档建模时创建和处理的数据。
实际上，
建模可被看作创建和编辑
Materials
Studio
文档的过程。
Materials Studio
文档可以通过导入很多标准格式创建，也可以
使用
Materials
Studio
自己的格式创建
和保存文档。文档可以显示在相关的察看窗口或工程
浏览窗口中。
文档可以使用拷贝和粘贴与其它程序交互数据。
现在
Materials
Studio
使用一下四种不同的文档格式：
?
3D
模型文档保存原子分子结构。
?
文本文档保存纯文本或
HTML
文件。
?
图形文档保存数值结构和分析。
?
表格文档包含表格数据。
三维模型文档
三
维
模
型
文
档
用
来
描
述<
/p>
Materials
Studio
中<
/p>
的
三
维
结
构
。
三维模型文档，在三维视图中显示的靛蓝晶体结构
Materials
Studio
中三维模型文档有四种不同类别：
?
三维原子文档：
< br>包含诸如有机分子、
高聚物、
有机金属化合物、框架结构
和分子晶
体等的原子结构。你可以使用
Materials
Visualizer
中的
atomistic
building
tools
创建
三维原子文档。
?
三维原子动画：
< br>包含一系列相关的原子结构或框架。原子动画可以用
Animation
工
具条的动画按钮控制放映。
?
三维介观文档：包含介观结构。你可以在
Materials
Studio
中创建空的三维介观文
档
，
然后使用文件编辑工具从已存在的三维介观文档中拷贝内容。
这些工具在
Edit
菜单和
Stand
ard
工具条。
注意
：不能在三维原子文档和三维介观文档之间拷贝粘贴。
?
三维介观动画：包含一系列的相关
结构结构或框架。三维介观动画可以使用
Animation
工
具条中的按钮控制播放。
所有的三维文档都可以包含
volumetic
data
，如电荷密度和等值面等。它们一般在
3D
Viewer
中显示。
文本文档
Materials
Studio
中文本文档包含纯文本或超文本。它们用
Text
Viewer
显示。
文本文档，用
Text
Viewer
显示的靛蓝粉末衍射指标结果。
图形文档
图形文档包含二维数值数据，如
Materials
Studio
产生的结果和导入的试验数据等。它
们用
Chart
Viewer
显示。
图形文档，
Chart
Viewer
显示的靛蓝粉末衍射数据。
表格文档
Materials St
udio
中表格文档存储表格数据。
它们以
Grid Viewer
显示为电子表格的形式。
表格文档，
Grid
Viewer
显示的靛蓝的粉末索引数据。
查看器
Materials Stu
dio
包括几种查看器。每种是用来显示
Materails
Studio
中一种文档。
Materails
Studio
中包括以下几种查看器：
?
3D Viewer
?
Chart Viewer
?
Grid Viewer
?
Text Viewer
3D Viewer
3D
Viewer
高质量地重现创建或导入
Materials
Studio
中的三维模型文档。
使用
Materials
Studi
o
工具条中的工具和菜单中的选项，你可以编辑、旋转、动画显示
或给三维模型加注释。
许多命令在快捷菜单中也有。在
3D
Viewer
中右击鼠标，快捷菜单就会出现。
3D
Viewer
显示一种无机晶体结构
Chart Viewer
Chart
Viewer
用来显示一系列的由
Materials Stu
dio
创建或从文件中载入的数据，
如二维
图形。你可以使用鼠标键盘操纵图形数据的显示，包括删除、改变比例、打印、保存或者拷
< br>贝等。
Chart
Viewer
并选定了一个区域放大
Grid Viewer
Grid View
可以为数据提供电子表格形式的显示，这些数据可以由
Materials S
tudio
创建
或从很多种类文件中导入。你可以选择数据并拷
到其它程序中。
Grid
Viewer
显示多个选区。
Text Viewer
Text
Viewer
可以显示你创建或导入到
Materials <
/p>
Studio
中的文本文件或超文本文件。你
可以把文本文件或超文本文件作为
Materials
Studio
工程的一部分保存。
在
Text
Viewer
中，你可以编辑、剪切、拷贝、粘贴、删除、保存和打印文本文件或超
文本
文件。
这些命令在快捷菜单中也有。在
Text
Viewer
中右击鼠标，快捷菜单中就有这些命令。
菜单
Materials
Studio
中的命令在
Materials
Studio
窗口上部的菜单条中。默认有一下菜单：
?
File
菜单
?
Edit
菜单
?
View
菜单
?
Modify
菜单
?
Build
菜单
?
Tools
菜单
?
Modules
菜单
?
Windows
菜单
?
Help
菜单
许多常用的菜单命令在工具条中也有，
这种命令对于的工具条图标也显示在菜单命令的
左边。一些命令也有快捷键，这些快捷键在菜单命令的右边显示出来。
< br>
File
菜单
File
菜单包含文件和工程操作的命令，如打开、保存、导入、打印。
File
菜单
它包含以下菜单项：
New Pro
ject
…
.
：打开
< br>New Project
对话框，可以创建新的
Materials
Studio
工程。
Open Pr
oject
…
.
：打开
Open
Project
对话框，可以定位并打开
Materials
Studio
工程。
Save
：
在当前工程中保存当前文档。
Save
As
……
：打开
Save
As
对话框，在当前工程中以新名字保存当前文档。
Import
…
.
：打
开
Import
Document
对话框，可以在当前工程中定位并导入文档。
Import URL
…
..
：打开
Import URL
对话框，可以使用
URL
定位并导入文档。
Export
…
.
：打开
Export
对话框，可以使用任何
M
aterials Studio
支持的导出文档格式在
当前工
程外保存当前文档。
Page Setup
< br>…
.
：打开
Page
Setup
对话框，包含以下选项卡：
?
Page
Layout
选项卡用来修改页边设置、页面方向、打印边界和特殊视图设置，这
些设置在
Materials
Studio
打印输出中用到。
?
Header/Footer
选项卡用来编辑页眉页脚，这些会在每页上都出现。
Print
…
.
：打开
Print
对话框，可以设置打印参数并打印当前文档。
Printer Setup
…
.
：打开
Print Setup
对话框，
可以修改打印机参数，
包括纸张大小，
打印
分辨率等。
Recent
Files
：显示九个最近使用的文档文件列表。
Pecent Projects
：
显
示九个最近使用的工程文件列表。
Exit
< br>：
关闭
Materials Studio
。如果有未保存的工作，将会在程序关闭前提示是否保存。
Edit
菜单
Edit
菜单包括编辑被选择的对象和使用剪贴板的命令。
注意：本菜单的内容随着文档类型的不同而不同。
表格文档的编辑菜单
所有的编辑菜单都包含一下菜单项：
Undo
：撤销上一次动作。
Redo
：重做上一次取消的动作。
Cut
：剪切当前文档中选择的对象到剪贴板中。
Copy
：拷贝当前文档中选择的对象到剪贴板中
。
Paste
：粘贴剪贴板中的内容
到当前文档中。
Delete
：删除
当前文档中选择的对象。
Select
All
：选择当前文档中的所以对象。
三维模型文档的
Edit
菜单
另外，当当前文档为三维模型文档时，
Edit
菜单还包括：
Insert
From
…
：读入指定的文件内容到当前三维模型文档中。这个命令会加和分子或
晶体
结构中与体积有关的数据或从黑塞矩阵中读出数据。
Atom
Selection
：
打开
Atom
Selection
对话框，可以按原
子的性质不同来选择结构中的
原子。
Edit Sets
：打开
Edit
Sets
对话框，可以处理存在于三维模型文档中的原子集合。
Find
Patterns
：打开
Find Patterns
对话框，可以在当前三维模型文档中寻找在另一个文
档中出现的结构模式
。
文本文档
Edit
菜单
当文本文档处于活动
状态时，
Edit
菜单还包括：
Find
…
.
：打
开
Find
对话框，可以在当前文档中搜索特定的字符串。
超文本文档
E
dit
菜单
当超文本文档处于活动状
态，
Edit
菜单还包括：
Edit Mode
：提示当前超文本文档处于编辑模式。在编
辑模式中，你可以在
Text Viewer
中编辑、剪切、拷
贝、粘贴、删除、保存和打印文件。
Browse
Mode
：提示当前超文本文档处于浏览模式。浏览模式下文件以在
Web
浏览器
中显示的方式显示。
图形文档
Edit
菜单
图表文档处于活动状态时，
Edit
菜单还包括：
Deselect
All
：全部不选择当前文档中的对象。
Delete
Graphs
：打开
Delete
Graphs
对话框，可以删除指定图形。
View
菜单
View
菜单包括改变
Materials Studio<
/p>
的显示外观的命令，包括工具条、浏览器和状态栏
的显示与否，工
程日子和
3D
Viewer
的显示参数。
注意
：此菜单的内容随着活动文档类型的不同而不同。
标准
View
菜单
所以
View
菜单包括以下菜单项：
Toolbars
：
显示所有
Materials Studio<
/p>
的工具条列表，
让你可以选择每一个工具条是否可
见。
Explorers
：
显示所有
Materials Studio
< br>的浏览器列表，
可以选择每一个浏览器是否可见。
Status
Bar
：设置状态栏是否可见。
Project
Log
：显示当前工程的工程日志。
三维模型文档
View
菜单
另外，当前文档为三维模型时，
View
菜单还包括：
Display
Style
：打开
Display
Style
对话框，改变结构或选择的原子的显示样式。
Display
Options
：打开
Display
Options
对话框，可以设置显示三维结构的显示参数。
Lighting
：打开
Lighti
ng
对话框，控制固体结构显示时的照明方式。
Label
：打开
Label
对话框，建立性质标签并设置个性化文本标签。
Modify
菜单
< br>Modify
菜单包括影响当前窗口显示对象的性质的命令。
Modify
菜单
它包括以下菜单项：
Element
Properties
：打开
Element Propert
ies
对话框，可以查看编辑元素性质，包括显
示颜色、原子半
径和原子质量。
Charges
：打
开
Charges
对话框，可以计算或设置原子电荷，定义电荷
基团。
Constraints
：打
开
Edit Constraints
对话框，定义原子位置、
晶格参数、相互距离、角度
和转矩上的约束。
Modify Element
：显示常见元素列表和元素周期
表，你可以改变选择原子的元素种类。
Modify
Bond Order
：显示不同的原子种类，可以改变所选原子的键种类。
Modify Hybridization
：
显示一系列不同氢键选项，可以改变所选原子的氢键。
Adjust Hydrogen
：计算所选原子或整体结构的
氢原子数量和位置。
Build
菜单
Build
菜单包含建立高聚物、晶体、表面和分层结构的命令。
< br>
Build
菜单
它包括以下菜单项：
Build
Polymers
：显示以下建立高聚物的选项。
建立高聚物选项
< br>Homopolymer
：
打开
Homopolymer
对话框，
建立不同取向和立构规整度均
聚物链。
Block
Copolymer
：打开
Block Copolymer<
/p>
对话框，可以建立不同取向和立构规整
度的嵌段共聚物和交替共聚
物链。
Random
Copomer
：打开
Random Copolymer
对话框，可以建立不同取向、不同立
构规整度和不同条件几率的无规
共聚物链。
Dendrimer
：打
开
Dendrimer
对话框，可以建立树状晶。
Repeat
Unit
：打开
Repeat
Unit
对话框，包含从所选部分建立重复单元的选项。
Branch
Points
：
打开
Branch P
ointer
对话框，
可以在存在的重复单元上添加分支点
或者修改已经定义的分子点。
Bonds
：
提供
Bond Caculatio
n
对话框，
可以使用指定条件计算当前三维模型中原子间的
键。
Close
Contacts
：提供
Close
Contact
Caculation
对话框，可以使用指定条件计算当前三
维模型中原子间密堆积。
H
－
Bonds
< br>：
提供
Hydrogen Bond Caculati
on
对话框，
可以使用指定条件计算当前三维模
型中的氢键。
Build
Layers
：打开
Build
Layers
对话框，可以由其它表面和晶体建立层状结构。
Crystals
：显示下面创建晶体选项：
< br>
晶体选项
Build/Rebuild
Crystal
…
.
：打开
Build
Crystal
对话框，从它们的组成、指定对称性
建立晶体，查看和修改晶格参数。
Build
Vacuum Slab
…
.
：打开<
/p>
Build Vacuum Slab Crystal
对话框，
可以从表面创建晶
体。
Surfac
es
：显示下列建立表面菜单：
表面菜单选项
Cleave
Surface
：打开
Cleave Surface
对话框，可以沿着指定方向剪切晶体，创建表
面。
Build/Rebuild Surface
…
.
：打开
Build Surface
对话框可以从组成元素、对称性建立
表面，查看编辑晶格参数。
Add
Atoms
：
打开
Add Atoms
对话框，
可以向当前文档添加指定氧化态、占有率和原子
温度因子的原子。
Symmetry
：显示下列对称性选项：
对称性菜单项
Show
Symmetry
：打开
Show
Symmetry
对话框，显示当前结构的对称性信息。
Lattice
Parameters
：打开
Lattice
Parameters
对话框，可以显示编辑当前晶体或表面的
晶格基矢的长度和夹角。
Find Symmetry
…
.
：打开
Find Symmetry
对话框，可以寻找当前晶体或非周期结构的对
称性并应用它。
< br>
Unbuild Crystal/Surface
：
取消当前建立的晶体或表面。
Nonperiodic Su
perstructure
：从无限晶体或表面中产生一个有限部分。
< br>
Make P1/Make p1
:
< br>从当前晶体或表面中去掉除平移周期性以外的其它对称性。
SuperCell
：打开
SuperCell
对话框，从当前晶体或表面建立一个超晶胞。
Redefine Lattice
：
打开
Redifine Lattice
对话框，
根据当前已经存在的晶体或表面，
重新
定义新的晶格
矢量。
Primitive
Cell/Rhombohedral Representation
：把当前不是以
原胞结构显示的晶体或表
面结构转换为原胞结构。
Conventional
Cell/Hexagonal
Representation
：把当前不是以晶胞显示的晶体
或表面以
晶胞显示。
Tools
菜单
Tools
菜单包括操作当前窗口中对象的命令，如查找等同原子、预览反应和振动
分析。
它也包括打开服务器控制窗口和选项对话框。
注意：此菜单内容随着活动文档类型的不同而不同。
标准
Tools
菜单
所有
Tools
菜单都包括以下菜单项：
Server Con
sole
：打开服务器控制窗口，查看运行在服务器上的任务。
Options
…
.
< br>：打开选项对话框，包含以下选项卡：
?
General
< br>选项卡用来改变
Materials
Studio
环境默认设置。
?
Folder
Locations
选项卡用来改变
Materials
Studio
使用的目录位置。
?
Graphics
选项卡用来改变
Materials
Studio
默认绘图设置。
三维模型文档
Tools
菜单
另外，当三维模型文档为当前活动文档时，
Too
ls
菜单还包括：
Find
Equivalent Atoms
：打开
Find
Equivalent Atoms
对话框，在当前文档中查找与出现
< br>在另一文档中出现的等同的原子。原子匹配对于使用
Reaction Prev
iew
对话框浏览反应路径
是必须的。
Reaction Preview
：
打开
Reaction Preview
对话框，
可以在反应物和化学反应生产物之间
使用内插法确定反应路径。
Vibrational
Analysis
：打开
Vibrational Analy
sis
对话框，可以在合适的三维模型文档中
计算分子的振动模
式。
Modules
菜单
Modules
菜单提供使用你安装了的
Materi
als Studio
模块的方法。
注意
：此菜单随着已经安装了的模块的不同而不同。
模块菜单
模块菜单包括一些或全部下述菜单项：
Amorphous
Cell
：提供
Amorphous
Cell
模块中的工具，可以建立复杂无定型系统中的
代表性模型并预测它们的性质。
CASTEP
：提供
CASTEP
模块中的工具，可
以进行第一原理量子力学计算，研究如半
导体、陶瓷、金属、矿物和浮石等晶体或表面的
性质。
Dmol3
:
提供
Dmol3
模块中的工具，可以进行基于泛函密度
理论的量子力学计算，分析
分子和周期系统。
PDP
：提供
PDP
模块中的
工具，可以进行大尺度长时间的介观动力学模拟。
Disco
ver
：提供
Discover
经典模
拟模块中的工具，可以优化分子结构，计算电子经典轨
道，分析很大范围内的结构和轨道
的性质。
Equilibria
：提
供
Equilibria
模块中的工具，可以确定烷烃和其它小
分子结构的相图。
Forcite
：
提供
Forcite
模块中的分子动力学工具，可以研究很大范
围内的系统。它最主
要的近似是原子核运动所处的势场用经典力场代替。
MesoDyn
：提供
Me
soDyn
模块中的工具，可以研究复杂流体动力学和在大尺度长时间
< br>中的平衡状态。
Reflex
：提供
Reflex
和
Relex P
lus
模块中的工具，可以查看、模拟、索引和精修粉末衍
射的
数据，求解晶体结构。
V
AMP
：提供
V
AMP
模
块中的工具，可以使用半经验量子力学算法模拟气体和溶液中
的反应和性质。
Window
菜单
<
/p>
Window
菜单包括组织显示打开文档窗口的命令。
Window
菜单
它包括以下菜单项：
Tile
Horizontally
：水平平铺所以打开的文档窗口。
Tile
Vertically
：垂直平铺所有打开的文档窗口。
Cascade
：重叠显示当前工程中打开的窗口。
Arrange
Icons
：在窗口左边整齐显示所有最小化的窗口。
Close
All
：关闭当前工程中所有打开的窗口。
< br>Windows
…
.
：打开
Windows
对话框，管理已经打开文档的窗口。
Help
菜单
Help
菜单包括获得
Materials
Studio
帮助系统或其它在线信息的命令。
Help
菜单
它包括以下菜单项：
Help
Topics
：显示
Materials Studio
Help Viewer
。所有帮助主题都列在目录栏。
Using
Help
：显示怎样使用帮助的主题。
Getting
Started
：显示开始使用
Maerials
Studio
的帮助主题，包括：
?
安装和系统需求。
?
许可。
?
从老版本升级。
?
简单演示
Tutorials
：显示已安装
Ma
terials Studio
模块的演示。
Accelys on the Web
：浏览
Accelrys
主页。
Materials Studio Home
Page
：浏览
Materials
Studio
主页
About
：显示有关
Materials
Studio
安装的信息。
Explorers
菜单
Materials Studio
集成了几个管理器。
可以快速方便的浏览显示数目较多的条目。
Materials
Studio
包括以下管理器。
?
Project Explore
?
Properties
Explore
?
Job
Explore
Project Explore
Materials
Studio
运
行你组织逻辑上有关的文档成一个集合，称之为工程。可以使用
Project
Explore
查看属于一个工程的文档。
Project Explore
Project
Explore
在
Materials Studio
启动时默认打开的。
View|Explorers|Project
Explorer
菜
单命令可以控制它的显示。
Project Explorer
中包括一个工程
管理明理的快捷工具条，
和工程文档和目录的管理器方
式的视图
。在一项上面右击鼠标，显示工程管理器快捷菜单，包含所有适用的命令。
一些
Materials
Studi
o
模块运行你自动或使用
Modules
工具条或
Modules
菜单中的
S
ave
Settings
…
选项在一
个特定类型文档中保存它们的当前设置。这种文件在
Project
< br>Explorer
中
以蓝色并以相应模块的图标显示，它
名字后面加上相应工具的名字。
Materials Stu
dio
工程使用当前文件夹的概念。
当
Materials Studio
创建或导入文档时，
文
档放在当前文档目录中。当前目录是这样确定的：
1.
如果一个文件夹或最高级别的工程项选定，它就是当前文件夹。
2.
如果选择的是一个文档，它所在的目录就是当前目录。
当前目录在
Project
Explore
中以黑体显示。
提示：
Materials Studio
创建的文档拥有不同的扩展名
（如：
.xsd
，
.xgd
，
.txt
等）
，
在
Proj
ect
Explorer
中同时看到文件名和扩展名是很有用
的。
如果
Project Expl
ore
没有显示文件扩展名
（如显示
3
D Model
Document
，
而不是
3D
Model
）
，你可以在
Windows
浏览器中修改文件夹选项。如下：
1.
在
Wi
ndows
浏览器中
（操作系统显示文件的窗口）
中选
“视图”
菜单
（在
Windows
Me
和更新的系统中选“
工具”菜单）
。
2.
在文件夹选项对话框中“查看”选项卡。
3.
“隐藏已知文件类型的扩展名”项不要选住。
4.
按“确定”按钮。
5.
从启动
Materials
Studio
。
Properties Explorer
Properties
Explore
显示在三维文档或图形文档中选定的对象的属性。对象包括图形标
记、原子、键、分子
等。当选择多个对象时，显示它们的共同属性。
Properties Explore
Materials
Studio
启
动
时
默
认
不
显
示
Properties
Expl
orer
。
你
可
以
通
过
View|Explorer
s|Properties
Explorer
菜单命令控制它的显示与否。
你可以通过双击属性列表中适当的显示栏来编辑属性的值。双击时，显示一个对话框，
键入新值。对话框的类型根据属性的不同而不同。
Properties
Explorer
顶部的
Filter
显示活动文档中选定对象的类型。从<
/p>
Filter
列表中选择
一直对象类型后
Properties
Explorer
就只显示那类对象的性质。
当选定一种以上对象类型（
Filter
没有设置为<
/p>
All
）
，属性列表只显示选定对象的共
有属
性。属性的值只在所有选定的对象都有相同的值时才显示。
并不是所有的属性都可以编辑。不能编辑的属性以灰色显示。
注意
：现在，
automatic
hydrogen adjustment
（自动氢原子调整）在用
Properties Explore
改变原子和键的属性后不会自动执行。
Job Explorer
任务管理器提供轻松管理工程任务
功能。
你可以使用任务管理器查看操作属于此工程的
任务。
Job Explorer
第一次运行
Materials
Studio
时
Job
Explore
不显示。你可以通过
View|Ex
plorers|Job
Explorer
菜单命令控制它的
显示。
Job
Explorer<
/p>
包括工程所属任务的列表，不同列显示任务的不同信息。默认情况下，列
< br>表安顺序包含以下列：
?
<
/p>
Description
：任务的文本描述。
?
Job
ID
：任务的唯一的识别码。
?
Gateway
< br>：运行此任务的机器及端口。
?
Server
：任务使用的服务器程序。
?
Status
：任务状态。
?
Progress
：任务以百分比显示的进度。
?
Start
Time
：任务开始时的日期和时间。
?
Results
folder
：结果将要保存到的目录。
你可以自定义这些列的显示顺序、
宽度以及是否显示，
以便
更好地显示对你最重要的信
息。
工具条
你可以使用工具条上的命令按钮快速执行常用命令。
使用
View
菜单关闭或显示工具条，也可以在
一个工具条上右击鼠标显示快捷菜单来控
制菜单条的显示。
三维视图工具条
三维视图工具条可以操纵处理显示在三维窗口中的对象。
它包括以下命令按钮：
Selection
：进入选择对象模式。
Rotation
：进入旋转模式。
Zoom
：缩放模式
Translation
：平移模式。
Reset
View
：复位到最初模式。
Recenter
View
：安选定的原子或整个结构在窗口中间显示。
Fit to
View
：把结构缩放到适合窗口的大小。
Display
Style
：显示
Display <
/p>
Style
对话框，可以通过它改变选定原子或整个结构的
显示方式。
动画工具条
动画工具条可以控制三维窗口中动画文件的显示。
它包含以下命令：
Play
Backwards
：倒映动画文件。