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Summary
该总结文件包含了所有在
Ma
xquant
运行当中所有原始数据文件的信息
名称
Raw file
Enzyme
Enzyme mode
Enzyme first
search
Enzyme mode first search
Use enzyme first search
Variable modifications
Multi
modifications
分隔
描述说明
原始数据的处理加工
用于消化蛋白样品的蛋白水解酶
同上
用于
first
search
的蛋白水解酶
同上
当
有<
/p>
不
同
的
蛋
白
酶
用
于
设
置
first
sea
rch
时，标记为“
+
”
（翻译为可变修饰）用于多肽鉴定当
中的可变修饰
多重修饰用于鉴定多肽当中
在
first
search
当中的可变修饰
当有不同的可变修饰用于设置
first
search
时，标记为“
+
”<
/p>
用在鉴定当中的标签的数量（例如同
位
素标签，
这里应该特质同位素标签）
的数量
同上
允许最大的漏切数量
用于标签实验当
中的标签，
其中，
0
为
轻标，
1
为中标，
2
为重标
LC-MS
运
行的模式，当用于数据依赖
性的传统的鸟枪法来做蛋白质组学
时
，设置为“
standard
”（标准模式）
< br>
时间依赖性的再校准：当出现该校准
时，数据框内标记
为“
+
”，时间依赖性
的校准用于提高
数据的质量
在原始数据当中的
MS1
记录的数据量
在原始数据当中的
MS2
记录的数据量
在原始数据当中的
MS3
记录的数据量
用于软件分析的串联的
MS
的数
量
用于软件分析的串联的
MS
的数量，
这里检测的是作为标记簇（重标组，
labeling cluster
）的母离子被检测。
用于软件分析的串联的
MS
的数量，
这里检测的是作为同位素模式的母离
1
Var
iable modifications first search
Use
variable
modifications
first
search
Requantify
Multiplicity
Max. missed
cleavages
Labels0
LC-MS run
type
Time-dependent
recalibration
MS
MS/MS
MS3
MS/MS
submitted
MS/MS submitted (SIL)
MS/MS submitted (ISO)
1
这里所说的串联质谱可以认为是二级质朴
子被检测。
MS/MS
submitted (PEAK)
用于软件分析的串联的
MS
的数量，
这
里
检
测
的
是
作
为
单
个
峰
（
single
peak
，这里的单个峰的意思应该是没
有同位素峰）的母离
子被检测。
鉴定到的串联质谱数的总数量
鉴定到
的串联质谱数的总数量，这里
检
测
的<
/p>
是
作
为
标
记
簇
（
重
标
组
，
labeling
cluster
）的母离子被检测。
鉴定到的串联质谱数的总数量，这里
检测的是作为同位素模式的母离子被
检测。
鉴定到的串联质谱数的总数量，这里
检测的是作为单个峰
（
single peak
，
这
里的单个峰的意思应该是没有同位
素
峰）的母离子被检测。
被鉴定到的串联质谱的比例
被鉴定到
的串联质谱的比例，这里检
测的是作为标记簇（重标组，
lab
eling
cluster
）的母离子被检测。
被鉴定到的串联质谱的比例，这里检
测的是作为同位素模式的母
离子被检
测。
被鉴定到的串联质谱的
比例，这里检
测的是作为单个峰
（
si
ngle peak
，
这里
的单个峰的
意思应该是没有同位素
峰）的母离子被检测。
通过记录在二级质谱上的谱图而鉴定
出来的氨基酸序列的多肽的总数量
被检测到的
MS1(full
scans)
的总数量
通过
MS2
测出氨基酸序列的多肽的总
数量
通过
MS2
测出氨基
酸序列的多肽的比
例（这里指的应该是串联质谱鉴定到
的多肽的
数量与
MS1
鉴定到的数量之
比）
在二级质谱当中被重复鉴定的次数
（超过
1
次）
在二
级质谱当中被重复鉴定的多肽的
数量站总鉴定多肽数量的比率
检测到的同位素峰的总数量
被二级质
谱
（测序）
鉴定到的同位素序
列的总数
量
被二级质谱
（测序）
鉴定到的同位素序
MS/MS identified
MS/MS identified (SIL)
MS/MS identified (ISO)
MS/MS identified (PEAK)
MS/MS identified [%]
MS/MS identified (SIL) [%]
MS/MS identified (ISO) [%]
MS/MS identified (PEAK) [%]
Peptide Sequences
Identified
Peaks
Peaks
Sequenced
Peaks Sequenced [%]
Peaks Repeatedly Sequenced
Peaks Repeatedly Sequenced [%]
Isotope Patterns
Isotope
Patterns Sequenced
Isotope
Patterns Sequenced (z>1)
列的
总数量（电荷数
>1
）
Isotope Patterns Sequenced [%]
被二级质谱
（测序）
鉴定到的同位素序
列的比例
被二级质谱
（测序）
鉴定到的同位素序
列的比例（电荷数
>1
）
用串联质谱对同位素重复
（超过
1
次）
测序的总数量
用串联质
谱对同位素重复
（超过
1
次）
测序的比率
重新校准：当原始数据当中的质量
被
重新校准时，会在该框下显示“
+
”
被鉴定的多肽和数据库当中的多肽对
比后，其检测质量与理论质量偏差的
平均值，单位为百万分之一
被鉴定的多肽和数据库当中的多肽对
比后，其检测质量与理论质
量偏差的
标准差，单位为百万分之一
被鉴定的多肽和数据库当中的多肽对
比后，其检测质量与理论质量偏差的
平均值，单位为百万分之一道尔顿
被鉴定的多肽和数
据库当中的多肽对
比后，其检测质量与理论质量偏差的
标准差，
单位为百万分之一道尔顿
用于
label-free
实验当中测
定峰强度
值的标准因素
Isotope Patterns Sequenced (z>1)
[%]
Isotope
Patterns Repeatedly
Sequenced
Isotope Patterns Repeatedly
Sequenced [%]
Recalibrated
Av.
Absolute
Mass
Deviation
[ppm]
Mass Standard Deviation [ppm]
Av.
Absolute
Mass
Deviation
[mDa]
Mass Standard
Deviation [mDa]
Label free
norm param
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